典型文献
基于网络药理学、分子对接与实验验证揭示薯蓣皂苷元治疗动脉粥样硬化的作用机制
文献摘要：
目的 通过网络药理学、分子对接结合体外验证的方法,探究薯蓣皂苷元抗动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的潜在靶点及作用机制.方法 通过SwissTargetPrediction、Pharmmapper、CheMBL数据库挖掘薯蓣皂苷元作用靶点,然后通过OMIM、Drugbank、Genecards、DisGeNET数据库预测与AS相关的靶点,取两者共同靶点,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;通过Cytoscape3.7.2软件进行可视化,筛选核心靶点并进行基因本体(gene ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;使用AutodockTools、PyMOL和Discovery Studio软件进行分子对接以验证薯蓣皂苷元和靶点的相关性.通过构建体外泡沫细胞模型,考察薯蓣皂苷元对泡沫细胞脂质代谢、促炎细胞因子水平及关键靶点表达的影响.结果 共获得588个薯蓣皂苷元靶点和5489个与AS相关的靶点,获得275个薯蓣皂苷元与AS的交叉靶点,通过PPI网络筛选获得Src、信号传导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)等52个关键靶点.GO功能富集分析表明,这些靶点主要与蛋白质磷酸化、细胞对脂质的反应,细胞迁移的正向调节、炎症反应等过程相关.KEGG通路富集分析发现,薯蓣皂苷元抗AS与脂质和动脉粥样硬化通路、核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)信号通路等有关.分子对接表明,薯蓣皂苷元与Src、STAT3具有良好的结合亲和力.体外实验表明,薯蓣皂苷元显著抑制THP-1巨噬细胞脂质堆积和促炎细胞因子水平(P＜0.05、0.01、0.001),显著下调Src和STAT3的磷酸化水平(P＜0.05、0.01、0.001).结论 薯蓣皂苷元能够通过调节多个靶点和通路发挥抗AS作用,其作用机制可能与调节Src/STAT3通路从而改善脂质代谢和炎症有关.
文献关键词：
薯蓣皂苷元;动脉粥样硬化;网络药理学;分子对接;Src;信号传导及转录激活蛋白3
中图分类号：
作者姓名：
王丹;王肖龙
作者机构：
上海中医药大学附属曙光医院国家中医心血管病临床医学研究中心分中心,上海 201203;上海中医药大学附属曙光医院心血管病研究所,上海 201203
文献出处：
引用格式：
[1]王丹;王肖龙-.基于网络药理学、分子对接与实验验证揭示薯蓣皂苷元治疗动脉粥样硬化的作用机制)[J].中草药,2022(24):7783-7794
A类：
CheMBL
B类：
网络药理学,分子对接,薯蓣皂苷元,结合体,抗动脉粥样硬化,atherosclerosis,AS,潜在靶点,SwissTargetPrediction,Pharmmapper,作用靶点,OMIM,Drugbank,Genecards,DisGeNET,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,Cytoscape3,核心靶点,基因本体,ontology,京都基因和基因组百科全书,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,通路富集分析,AutodockTools,PyMOL,Discovery,Studio,泡沫细胞,细胞模型,脂质代谢,促炎细胞因子,细胞因子水平,关键靶点,共获,Src,信号传导,转录激活蛋白,signal,transducer,activator,transcription,STAT3,功能富集分析,蛋白质磷酸化,细胞迁移,核因子,nuclear,结合亲和力,体外实验,THP,巨噬细胞,脂质堆积
AB值：
0.230243
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