典型文献
基于网络药理学和分子对接技术的热毒宁注射液抗SARS、MERS和COVID-19的潜在共性作用机制与活性成分研究
文献摘要:
目的 采用网络药理学与分子对接技术探讨热毒宁注射液抗严重急性呼吸综合征(SARS)、中东呼吸综合征(MERS)和新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在共性作用机制与活性成分.方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库检索热毒宁注射液中青蒿、金银花、栀子的主要化学成分及其作用靶点.运用UniProt数据库查询相关靶点对应的基因,通过Cytoscape 3.8.2构建中药材-化合物-靶点(基因)网络;在GeneCards数据库中搜集"COVID-19""SARS"和"MERS"相关靶点,通过Venny 2.1.0数据库映射筛选出3种冠状病毒感染疾病的共有靶点;将SARS、MERS和COVID-19的共有靶点与热毒宁注射液化合物靶点进行交集筛选出共同靶点作为研究靶点;将共同靶点导入STRING数据库获取数据后,使用Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的网络图;利用R语言进行基因本体论(GO)生物学功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,绘制柱状图及气泡图进行可视化分析,并构建成分-靶点-通路网络图;选取成分-靶点-通路网络中关键化合物与重要靶点蛋白及新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶、血管紧张素转化酶II(ACE2)进行分子对接.结果 热毒宁注射液筛选得到31个活性化合物中,207个相应作用靶点;SARS相关靶点2 453个,MERS相关靶点805个,COVID-19相关靶点2 571个,3种疾病共有靶点786个,与热毒宁注射液的共同靶点11个,分别为HSPA5、CRP、MAPK1、HMOX1、TGFB1、HSP90AA1,TP53、DPP4、CXCL10、PLAT、PRKACA.GO功能富集分析得到生物进程(BP)995个,分子功能(MF)71种,细胞组分(CC)31种.KEGG通路富集分析筛选得到99条信号通路(P<0.05),主要涉及前列腺癌、流体剪切应力和动脉粥样硬化、肝细胞癌、癌症中的蛋白多糖、脂质与动脉粥样硬化、人类T细胞白血病病毒1型感染、MAPK信号通路等.分子对接结果显示热毒宁注射液中槲皮素、木犀草素、山柰酚3种核心活性黄酮类化合物与关键靶点MAPK1、PRKACA、HSP90AA1具有很好的亲和力,并且3种活性化合物与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2结合能较推荐化学药小.结论 热毒宁注射液对SARS、MERS和COVID-19 3种疾病具有潜在共性作用,该作用可能与活性化合物槲皮素、木犀草素、山柰酚等作用于MAPK1、PRKACA、HSP90AA1等靶点,调节多种信号通路发挥抑制炎症风暴、调节免疫功能、抗病毒等作用有关.
文献关键词:
热毒宁注射液;槲皮素;山柰酚;木犀草素;严重急性呼吸综合征;中东呼吸综合征;新型冠状病毒肺炎;网络药理学
中图分类号:
作者姓名:
王高举;焦红军
作者机构:
郑州大学第二附属医院,河南郑州 450014
文献出处:
引用格式:
[1]王高举;焦红军-.基于网络药理学和分子对接技术的热毒宁注射液抗SARS、MERS和COVID-19的潜在共性作用机制与活性成分研究)[J].药物评价研究,2022(05):842-852
A类:
B类:
分子对接技术,热毒宁注射液,SARS,MERS,活性成分,网络药理学与分子对接,技术探讨,严重急性呼吸综合征,中东呼吸综合征,系统药理学,分析平台,TCMSP,数据库检索,中青,青蒿,金银花,栀子,主要化学成分,作用靶点,UniProt,数据库查询,Cytoscape,中药材,GeneCards,Venny,冠状病毒感染,感染疾病,液化,交集,STRING,获取数据,软件构建,蛋白质相互作用,PPI,网络图,基因本体论,生物学功能,功能富集分析,京都基因和基因组百科全书,信号通路富集,通路富集分析,柱状图,气泡图,通路网络,靶点蛋白,白及,CoV,3CL,水解酶,血管紧张素转化酶,II,ACE2,选得,活性化合物,应作,HSPA5,MAPK1,HMOX1,TGFB1,HSP90AA1,TP53,DPP4,CXCL10,PLAT,PRKACA,MF,CC,前列腺癌,流体剪切应力,动脉粥样硬化,肝细胞癌,白血病,槲皮素,木犀草素,山柰酚,黄酮类化合物,关键靶点,亲和力,结合能,化学药,抑制炎症,炎症风暴,调节免疫,抗病毒
AB值:
0.272314
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