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基于网络药理学和分子对接的丹参酮ⅡA治疗糖尿病肾病的机制研究
文献摘要：
目的 基于网络药理学和分子对接的方法研究丹参酮IIA治疗糖尿病肾病的分子的机制.方法 利用Swiss Target Prediction、TCMSP、PharmMapper、GeneCards平台预测丹参酮IIA的作用靶点,从OMIM、DrugBank、TTD、GeneCards数据库中筛选获得糖尿病肾病的相关靶点.将得到的丹参酮IIA的作用靶点与疾病靶点取交集得到潜在靶点,构建蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选核心靶点.采用Metascape平台分析对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.最后运用AutoDock Vina 1.1.2对丹参酮IIA和核心靶点之间进行分子对接验证.结果 共筛选出96个丹参酮IIA调控糖尿病肾病的潜在靶点,通过网络拓扑分析中的度(degree)值筛选出白蛋白(ALB)、蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白p53(TP53)、丝裂原激活蛋白激酶8(MAPK8)、胱天蛋白酶3(CASP3)8个核心靶点;GO富集分析筛选出活性氧代谢过程、细胞迁移的正向调节、氧化应激反应、细胞死亡的正向调节等20个生物学过程,KEGG富集筛选出流体剪切应力和动脉粥样硬化通路、肿瘤坏死因子信号通路、叉头转录因子(FoxO)信号通路、VEGF等20条通路.分子对接验证结果显示,核心靶点与丹参酮ⅡA之间均有良好的结合活性.结论 本研究表明丹参酮ⅡA可能通过多靶点、多通路调控糖尿病肾病.
文献关键词：
丹参酮ⅡA;糖尿病肾病;网络药理学;分子对接;白蛋白;蛋白激酶B1;白细胞介素6;血管内皮生长因子;肿瘤坏死因子;肿瘤蛋白p53;丝裂原激活蛋白激酶8;胱天蛋白酶3
中图分类号：
作者姓名：
陈正涛;杨燕;梁清芝;唐诗韵;谢春光
作者机构：
成都中医药大学附属医院,四川 成都 610072
文献出处：
引用格式：
[1]陈正涛;杨燕;梁清芝;唐诗韵;谢春光-.基于网络药理学和分子对接的丹参酮ⅡA治疗糖尿病肾病的机制研究)[J].现代药物与临床,2022(11):2457-2464
A类：
B类：
网络药理学,分子对接,丹参酮,治疗糖尿病肾病,IIA,Swiss,Target,Prediction,TCMSP,PharmMapper,GeneCards,作用靶点,OMIM,DrugBank,TTD,潜在靶点,蛋白质相互作用,PPI,网络拓扑分析,核心靶点,Metascape,交集靶点,基因本体,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,通路富集分析,AutoDock,Vina,degree,ALB,B1,AKT1,血管内皮生长因子,VEGFA,p53,TP53,丝裂原激活蛋白激酶,MAPK8,胱天蛋白酶,CASP3,出活,活性氧代谢,代谢过程,细胞迁移,氧化应激反应,细胞死亡,生物学过程,出流,流体剪切应力,动脉粥样硬化,肿瘤坏死因子信号通路,叉头转录因子,FoxO,结合活性,多靶点,多通路
AB值：
0.264384
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