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典型文献
基于网络药理学及分子对接探讨淡豆豉抗抑郁的作用机制
文献摘要:
目的 采用网络药理学和分子对接技术预测淡豆豉抗抑郁活性成分、作用靶点及通路,探讨其潜在作用机制.方法 利用CNKI、TCMSP、TCMIP检索并筛选淡豆豉抗抑郁潜在活性成分;运用PharmMapper服务器预测活性成分的作用靶点;利用UniProt数据库查询靶点蛋白对应的基因名;运用DrugBank、GeneCards和DisGeNET数据库检索抗抑郁作用靶基因,并将活性成分靶点相互映射获得淡豆豉活性成分抗抑郁靶点;通过String数据库下载靶蛋白相互作用数据,与获取的潜在作用靶点利用Cytoscape 3.7.2.软件构建淡豆豉–活性成分–潜在靶点相互作用网络图.运用DAVID数据库分析潜在靶点的基因本体(GO)分子功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路,最后利用Autodock Vina和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接验证.结果 预测获得淡豆豉主要活性成分8个,作用靶点396个,与抑郁症交集潜在靶点334个,GO分子功能和KEGG通路涉及多种生物学过程以及脂质和动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、小分子量G蛋白(Ras)信号通路、叉头框蛋白(FoxO)信号通路等多个信号通路.将关键活性成分和靶点进行对接,其中丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)与大豆苷元结合能力较好;磷酸肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)与木犀草素、槲皮素结合能力较好;HSP90-α热休克蛋白(HSP90AA1)与黄豆黄素结合能力较好.结论 淡豆豉以多种活性成分、多个作用靶点和途径发挥其抗抑郁作用,为淡豆豉在临床上用于抑郁症的干预和治疗提供依据.
文献关键词:
淡豆豉;抗抑郁;网络药理学;分子对接;作用机制;大豆苷元;木犀草素;槲皮素;黄豆黄素
作者姓名:
胡琪;陈丽艳;郑宏宇;孙银玲;丁纯洁;王伟明
作者机构:
黑龙江省中医药科学院,黑龙江 哈尔滨 150036
文献出处:
引用格式:
[1]胡琪;陈丽艳;郑宏宇;孙银玲;丁纯洁;王伟明-.基于网络药理学及分子对接探讨淡豆豉抗抑郁的作用机制)[J].现代药物与临床,2022(07):1473-1481
A类:
黄豆黄素
B类:
网络药理学,淡豆豉,分子对接技术,技术预测,作用靶点,潜在作用,TCMSP,TCMIP,PharmMapper,服务器,UniProt,数据库查询,靶点蛋白,DrugBank,GeneCards,DisGeNET,数据库检索,抗抑郁作用,靶基因,活性成分靶点,互映,String,下载,靶蛋白,蛋白相互作用,Cytoscape,软件构建,潜在靶点,相互作用网络,网络图,DAVID,数据库分析,基因本体,京都基因与基因组百科全书,Autodock,Vina,Pymol,对药,关键靶点,主要活性成分,抑郁症,交集,生物学过程,动脉粥样硬化,磷脂酰肌醇,PI3K,Akt,小分子,分子量,Ras,叉头框蛋白,FoxO,关键活性成分,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,AKT1,大豆苷元,元结,结合能,磷酸肌醇,调节亚基,PIK3R1,木犀草素,槲皮素,热休克蛋白,HSP90AA1
AB值:
0.314267
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