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典型文献
基于生物信息学方法筛选分析与COPD相关基因
文献摘要:
目的 通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与慢阻肺(COPD)相关的共表达基因,探讨其在COPD发病过程中的作用.方法 从GEO数据库获得基因芯片数据,行差异分析获得差异表达基因(DEGs),经WGCNA构建COPD加权共表达网络,获取与临床性状最相关的模块基因,与差异基因取交集获得共表达基因后,经GO、KEGG、蛋白质互作(PPI)分析获得COPD发生及发展过程中可能的关键基因.结果 筛选出差异表达基因602个,含上调基因295个,下调基因307个;获得1个与COPD高度相关的模块(purple
文献关键词:
COPD;WGCNA;生物信息学
作者姓名:
吴德洪
作者机构:
成都市第三人民医院呼吸与危重症医学科,四川 成都 610031
文献出处:
引用格式:
[1]吴德洪-.基于生物信息学方法筛选分析与COPD相关基因)[J].医学美学美容,2022(21):120-122
A类:
B类:
生物信息学方法,COPD,加权基因共表达网络分析,WGCNA,慢阻肺,共表达基因,GEO,基因芯片,差异表达基因,DEGs,加权共表达网络,差异基因,交集,PPI,关键基因,出差,purple
AB值:
0.286271
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