典型文献
多组学数据整合分析显示皮肤衰老过程中免疫微环境的改变特征
文献摘要：
目的 研究皮肤自然衰老过程中基因表达和免疫微环境的动态变化.方法 收集GTE x项目中699个皮肤组织转录组测序数据(RNA-seq),依据年龄段分为年轻组(20～39岁)和衰老组(60～79岁),进行差异基因表达分析.用CIBERSORT预测样本的免疫细胞浸润度,分析其随皮肤衰老的动态变化;用Seurat对已公开皮肤单细胞转录组数据(scRNA-seq)进行分析,观察免疫细胞群体随衰老的动态变化;比较年轻组和衰老组各细胞类群中免疫相关基因的动态表达变化.结果 对年轻组与衰老组进行差异表达分析显示,非暴露和暴露皮肤组织中转录表达水平发生了明显变化,衰老皮肤组织中转录上调的基因中显著富集炎症相关通路;多年龄段数据分析显示49个炎症水平相关基因的表达水平随皮肤衰老逐渐上调.免疫细胞浸润度预测分析显示年轻组与衰老组间无明显差异,但其在衰老皮肤组织中个体异质性大;对衰老和年轻皮肤组织的scRNA-seq进行分析,发现T细胞及其他免疫细胞亚群的大小随衰老逐渐下降,同时发现非免疫细胞中免疫相关基因随皮肤衰老表达上调.结论 皮肤衰老过程中基因转录表达和免疫微环境发生明显改变,炎症相关基因明显上调;T细胞类群数量明显减少,多种主要非免疫细胞类群表达炎症相关因子,表明非免疫细胞可能在皮肤衰老过程中发挥重要作用.
文献关键词：
皮肤;衰老;单细胞;免疫微环境;转录组学
中图分类号：
作者姓名：
滕小娟;林静霞;张永军;曾鑫权;李雪飞;何仁亮;周家健
作者机构：
南方医科大学皮肤病医院,广东 广州 510091
文献出处：
引用格式：
[1]滕小娟;林静霞;张永军;曾鑫权;李雪飞;何仁亮;周家健-.多组学数据整合分析显示皮肤衰老过程中免疫微环境的改变特征)[J].皮肤性病诊疗学杂志,2022(03):197-205
A类：
B类：
多组学数据整合,数据整合分析,皮肤衰老,衰老过程,免疫微环境,改变特征,自然衰老,GTE,皮肤组织,转录组测序,序数,seq,差异基因表达分析,CIBERSORT,预测样本,免疫细胞浸润,Seurat,单细胞转录组,转录组数据,scRNA,类群,免疫相关基因,动态表达,表达变化,差异表达分析,转录表达,相关通路,炎症水平,预测分析,个体异质性,免疫细胞亚群,老表,基因转录,因明,炎症相关因子,转录组学
AB值：
0.290753
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
