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典型文献
基于"食品有效成分-网络靶点-效应预测"和实验验证探究甘蔗中原花青素对心肌缺血的预防机制研究
文献摘要:
目的:通过网络药理学和分子对接探索甘蔗中原花青素防治心肌缺血(MI)的潜在靶点、通路及分子机制.方法:综合运用OMIM、Genecards、Pharmmapper以及Swiss等数据库采集与MI、原花青素(PC)相关的靶点信息,接下来对PC与MI两者靶点的交集通过联线(STRING)函数进行分析,确定蛋白的作用关系,并综合运用功能富集分析数据库(DAVID)、基金本体数据库(GO)以及基因和基因组的京都百科全书数据库(KEGG)进行研究.接下来通过体外实验和分子对接的方式验证前文所得的结论.结果:本研究共预测到23个潜在靶点、652个疾病关键靶点.GO功能富集收集到654个生物过程、5个分子功能、27个细胞组分(P<0.05).KEGG富集采集到的通路为23条,数据存在统计学价值,P的数值不足0.05.分子对接结果显示,丝裂原激活蛋白激酶14(MAPK14)、基质金属蛋白酶2(MMP2)和血管内皮生长因子A(VEGFA)对接能量低于-7 kcal/mol.体外实验表明,200μg/mL原花青素组可显著提高VEGFA的mRNA表达水平(P<0.05),同时,明显降低MAPK14和MMP-2的mRNA表达水平(P<0.05).结论:本研究通过网络生物信息技术和实验验证探究甘蔗中PC防治MI的作用机制,为探索食品的功能活性研究提供理论基础和新思路.
文献关键词:
甘蔗;原花青素;心肌缺血;生物信息分析;分子对接
作者姓名:
杨晓艺;黄小松;黄怡倩;曾诚
作者机构:
浙江大学医学院附属第四医院,浙江 金华 322000
文献出处:
引用格式:
[1]杨晓艺;黄小松;黄怡倩;曾诚-.基于"食品有效成分-网络靶点-效应预测"和实验验证探究甘蔗中原花青素对心肌缺血的预防机制研究)[J].医学食疗与健康,2022(23):158-163
A类:
B类:
有效成分,甘蔗,原花青素,心肌缺血,预防机制,网络药理学,分子对接,潜在靶点,OMIM,Genecards,Pharmmapper,Swiss,接下来,交集,联线,STRING,功能富集分析,DAVID,京都,百科全书,体外实验,前文,关键靶点,生物过程,集采,丝裂原激活蛋白激酶,MAPK14,基质金属蛋白酶,MMP2,血管内皮生长因子,VEGFA,kcal,生物信息技术,功能活性,活性研究,生物信息分析
AB值:
0.295435
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