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标本组学——树木学研究的新方法
文献摘要：
树木学是一门不断发展、高度综合的学科.系统发生是树木学的基础,研究材料和序列数据一直是限制系统发生重建的重要因素.新技术的发展和应用通过拓展材料利用、改进和提升系统发生树的分辨率而将树木学的研究推向新的高度.标本馆不仅是树木物种凭证标本的保存地,保存了物种的形态、地理分布、生态、物候等信息,而且是重要的材料库.标本材料因制作和保存过程中高温和氧化导致基因组DNA降解和破碎化,一代测序技术由于技术限制而无法充分利用馆藏标本开展生命之树重建研究.新兴的标本组学是近年来基于二代测序技术发展起来的获取标本材料中基因组DNA的技术,这种技术通过对短片段测序和生物信息学方法拼接获得基因组DNA序列,因此可以充分利用馆藏标本材料,结合浅层测序和靶序列捕获能获得包括nrITS、叶绿体基因组、线粒体基因组以及单拷贝核基因等序列,从而满足系统发生重建的需要,且有着经济、省时、高效、准确的优势.新兴标本组学的应用将加速生命之树重建、DNA条形码、物种保护和资源可持续利用等方面的研究.
文献关键词：
树木分类;标本组学;系统发生
中图分类号：
作者姓名：
杨永;杨智;段一凡;方炎明
作者机构：
南京林业大学生物与环境学院,江苏 南京 210037
文献出处：
引用格式：
[1]杨永;杨智;段一凡;方炎明-.标本组学——树木学研究的新方法)[J].南京林业大学学报（自然科学版）,2022(01):1-6
A类：
标本组学,nrITS
B类：
树木学,序列数据,提升系统,系统发生树,推向,本馆,凭证,地理分布,物候,材料库,中高温,破碎化,一代测序,馆藏标本,二代测序技术,短片,生物信息学方法,拼接,接获,靶序列,获能,叶绿体基因组,线粒体基因组,单拷贝核基因,省时,速生,条形码,物种保护,可持续利用,树木分类
AB值：
0.317098
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