将采自多雄藏布支流(N29°27'58.72",E 86°54'36.06")的90尾雌性黑斑原(Glyptosternum maculatum)分为3组,每组30尾:A组为对照组,水温为12℃;B组以2℃/h从12℃下降到4℃;C组以2℃/h上升,达到24℃时,黑斑原濒死时开始实验,利用转录组数据分析黑斑原在温度诱导后的选择性剪接的变化.结果表明:高温组(24℃)、对照组(12℃)和低温组(4℃)处理后,黑斑原肝脏中选择性剪接事件存在互斥外显子(MXE)和外显子跳跃(SE)两种类型;高温和低温处理后选择性剪接事件和基因均明显减少,高温组和低温组分别比对照组减少了16.39％、16.35％和5.17％、6.21％;与对照相比,24℃和4℃分别有75和32个特有基因高表达.GO分析显示,在24℃时分别有190、88和318个基因富集到生物学过程、细胞定位和分子功能,而4℃分别有101、50和210个基因富集到这3个GO分类中.KEGG分析显示,83和9通路分别显著富集在24℃和4℃,其中通路内质网蛋白质加工和嘌呤代谢在高温组和低温组共有,2个通路中显著差异基因为xdh、papss2、impdh1、polr3h、dnajc1、derl2和dnajc10,其中dnajc1基因在高温组和低温组均差异显著.dnajc1基因属hsp40亚家族成员,生物信息学分析发现dnajc1基因在4℃和12℃中均为1个剪接体,高温处理后产生了2个剪接体,说明dnajc1基因在黑斑原遭遇温度诱导后肝脏通过产生选择性剪接体来保护细胞内的稳态.本研究首次研究了黑斑原应对温度反应的选择性剪接,为了解鱼类应对非生物应激的分子机制提供理论基础.

转录组;黑斑原;温度诱导;选择性剪接

王万良;周建设;扎西拉姆;张驰;陈美群

西藏自治区农牧科学院水产科学研究所,西藏 拉萨 850032;河南农业大学动物科技学院,河南 郑州 450046

水产学杂志

[1]王万良;周建设;扎西拉姆;张驰;陈美群-.基于转录组分析温度诱导黑斑原(Glyptosternum maculatum)选择性剪接的变化)[J].水产学杂志,2022(06):1-9

黑斑原,Glyptosternum,maculatum,MXE,xdh,papss2,impdh1,polr3h,dnajc1,derl2,dnajc10,hsp40

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