典型文献
基于转录组学技术对斑马鱼肝脏组织低氧胁迫影响的研究
文献摘要：
为探究鱼类响应低氧胁迫的调控机制,将1月龄的野生型斑马鱼(Danio rerio)在1.5 mg·L-1的低氧浓度下胁迫2个月后,对其肝脏组织进行转录组测序比较分析.对常氧与低氧组的3 270个差异基因进行KEGG分析,主要富集于细胞增殖、脂质代谢、糖类代谢和氨基酸代谢等通路.其中,上调的1 864个基因主要与细胞增殖相关,下调的1 406个基因主要参与脂质代谢.对差异基因进行GO富集分析,发现铁离子束(Iron ion banding)功能差异显著.对铁代谢相关基因的表达量进行分析,发现铁离子储存相关基因fthl28和fthl31变化显著,提示在低氧胁迫下斑马鱼肝脏(Zebrafish liver,ZFL)组织中铁离子含量发生显著变化.利用ZFL细胞进行体外验证实验,将ZFL细胞进行0.1％(体积分数)O2低氧胁迫,发现随着胁迫时间的延长,ZFL细胞的成活率降低,且细胞中与铁代谢相关基因和铁蛋白(Ferritin)的表达均显著降低.综上所述,铁代谢调节是低氧胁迫下的重要响应过程,低氧会导致细胞内铁代谢紊乱,延长低氧时间会形成新的铁稳态.研究结果为探究鱼类的低氧适应机制提供了理论基础和参考.
文献关键词：
斑马鱼;转录组;低氧胁迫;肝脏;铁代谢
中图分类号：
作者姓名：
宋汝浩;胡瑞芹;李根芳;张智聪;许强华
作者机构：
上海海洋大学海洋科学学院,上海201306;大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室,上海201306;国家海洋生物科学国际联合研究中心,上海201306;水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/水产科学国家级实验教学示范中心,上海201306
文献出处：
引用格式：
[1]宋汝浩;胡瑞芹;李根芳;张智聪;许强华-.基于转录组学技术对斑马鱼肝脏组织低氧胁迫影响的研究)[J].南方水产科学,2022(06):60-68
A类：
fthl28,fthl31
B类：
转录组学,组学技术,斑马鱼,鱼肝,肝脏组织,低氧胁迫,鱼类,调控机制,月龄,野生型,Danio,rerio,氧浓度,转录组测序,常氧,差异基因,脂质代谢,糖类,氨基酸代谢,富集分析,铁离子,离子束,Iron,ion,banding,功能差异,代谢相关基因,Zebrafish,liver,ZFL,中铁,离子含量,验证实验,O2,成活率,铁蛋白,Ferritin,综上所述,代谢调节,响应过程,铁代谢紊乱,铁稳态,低氧适应机制
AB值：
0.339599
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