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典型文献
贵州省5个金背鲤(Cyprinus carpio var.Jinbei)地理种群的遗传多样性与遗传结构分析
文献摘要:
为探究稻田养殖金背鲤Cyprinus carpio var.Jinbei遗传多样性现状,采用线粒体DNA D-loop基因联合Cyt b基因测序分析方法,2020年8—10月分析评价了贵州省黎平县、从江县、锦屏县、都匀市和黄平县5个地理种群体质量379.4~431.8 g、体长22.51~24.90 cm金背鲤的遗传多样性、遗传结构及种群历史动态.结果显示,D-loop区共界定了21种单倍型,5个地理种群整体单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.672和0.00533.Cyt b基因共界定了28种单倍型,5个地理种群整体单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.805和0.00413.单倍型邻近系统树与单倍型网络图显示,金背鲤5个群体间没有形成明显的谱系结构和地理结构.AMOVA分析结果显示,基于D-loop和Cyt b基因,遗传变异系数Fst分别为0.06871和0.13447,群体间变异分别占6.87%和13.45%,群体内变异分别占93.13%和86.55%.基因流Nm值显示,除黄平与黎平群体基因流Nm值无限大(Inf),锦屏、从江群体与黄平群体Nm>1外,其余种群间均Nm<1.5个地理种群中性检验结果均未出现显著负值,核苷酸错配图显示双峰或多峰.贵州省稻田金背鲤总体遗传多样性偏低,尤其锦屏群体遗传多样性匮乏,遗传变异主要发生在种群内部,各地理群体历史上未发生过种群扩张.建议加强贵州省金背鲤遗传资源保护,将分化程度不同的群体作为独立的管理单元,以开展针对性保护措施.
文献关键词:
稻田养殖;金背鲤;遗传多样性;遗传结构
作者姓名:
纪达;许劲松;姚俊杰;安元银;赵武;余忠奎;张昌帮
作者机构:
贵州大学渔业资源与环境研究中心,贵州 贵阳 550025;贵州省水产技术推广站,贵州 贵阳 550025;贵州省台江县水产技术推广站,贵州 台江 556300
文献出处:
引用格式:
[1]纪达;许劲松;姚俊杰;安元银;赵武;余忠奎;张昌帮-.贵州省5个金背鲤(Cyprinus carpio var.Jinbei)地理种群的遗传多样性与遗传结构分析)[J].水产学杂志,2022(05):8-17
A类:
金背鲤,Jinbei
B类:
Cyprinus,carpio,var,地理种群,遗传多样性,遗传结构分析,稻田养殖,loop,Cyt,基因测序,测序分析,黎平县,从江县,锦屏县,都匀市,黄平县,群体质量,体长,种群历史动态,单倍型多样性,多样性指数,Hd,核苷酸多样性,Pi,网络图,群体间,谱系结构,AMOVA,遗传变异,Fst,群体内,基因流,Nm,无限大,Inf,余种,中性检验,负值,错配,配图,双峰,多峰,群体遗传,地理群体,群体历史,种群扩张,遗传资源保护,分化程度,管理单元,保护措施
AB值:
0.333565
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