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典型文献
基于SSU rDNA序列的网状车轮虫群体遗传结构及多样性研究
文献摘要:
基于SSU rDNA序列对当前分布于我国的网状车轮虫(Trichodina reticulata Hirschman&Partsch,1955)的群体遗传结构与多样性进行了研究.遗传结构研究结果表明:20个样本共检测到9个单倍型,含4个共享单倍型与5个特有单倍型,其中鲫来源的Hap3是最大的共享单倍型;草鱼来源的Hap8和小黄黝鱼来源的Hap9暂被视为湖北武汉和西藏地区各自特有的单倍型;同时推测鲫来源的单倍型Hap1为祖先单倍型.结合ML系统发育树分析推测,在多宿主的进化历程中,鲫寄生的网状车轮虫可能是分化最早的群体,且草鱼寄生的网状车轮虫在起源上来自于鲫.遗传多样性结果显示,所有群体均呈现较高的单倍型多样性(Hd≥0.5)与较低的核苷酸多样性(Pi<0.005),且鲫来源的单倍型多样性显著高于草鱼来源,但核苷酸多样性(Pi)明显低于后者.遗传分化(Fst)与基因流(Nm)研究结果表明,Group A(鲫来源)与Group B(草鱼来源)群体间相对独立且已经达到了极度分化程度,群体内基因层面的交流较少.综合中性检验与核苷酸单倍型错配分析认为,Group A(鲫来源)未发生过种群扩张,Group B(草鱼来源)则存在过早期的种群扩张历史.
文献关键词:
SSU rDNA;单倍型多样性;核苷酸多样性;遗传分化;基因流;网状车轮虫
作者姓名:
许治祥;唐发辉;赵元莙
作者机构:
重庆师范大学生命科学学院,重庆市动物生物学重点实验室,重庆401331
文献出处:
引用格式:
[1]许治祥;唐发辉;赵元莙-.基于SSU rDNA序列的网状车轮虫群体遗传结构及多样性研究)[J].水生生物学报,2022(09):1412-1419
A类:
网状车轮虫,Trichodina,Hirschman,Partsch,Hap8,Hap9
B类:
SSU,rDNA,群体遗传结构,多样性研究,reticulata,结构研究,Hap3,草鱼,湖北武汉,西藏地区,Hap1,祖先,ML,系统发育树分析,宿主,寄生,遗传多样性,单倍型多样性,Hd,核苷酸多样性,Pi,遗传分化,Fst,基因流,Nm,Group,群体间,极度,分化程度,群体内,中性检验,错配分析,种群扩张,过早
AB值:
0.267701
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