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基于线粒体序列的新疆4个河鲈野生群体的遗传现状分析
文献摘要：
为了解我国新疆地区河鲈(Perca fluviatilis)的遗传现状,本研究分析了新疆乌伦古河水系和喀啦额尔齐斯河4个河鲈野生群体的线粒体CO Ⅰ、Cytb和D-loop3个区段序列的遗传多样性,并与欧洲群体进行了比较.结果显示,新疆4个群体的线粒体CO Ⅰ、Cytb基因和D-loop区序列分别有3、10和10个变异位点(分别占序列总长的0.49％,0.90％和 1.92％),定义了 4、11 和 11 个单倍型,单倍型多样性分别为 0.065±0.022、0.276±0.049 和 0.186±0.046,核苷酸多样性分别为0.00011±0.00004、0.00033±0.00007和0.00084±0.00013,呈现出低水平遗传多样性.中国新疆河鲈群体和欧洲群体不存在共享的单倍型,单倍型聚类树和网络图也表现出明显分隔,两者为不同的遗传系谱.中国新疆乌伦古河水系的乌伦古湖(WL)、吉力湖(JH)和乌伦古河(WR)3个群体基于Cyt b基因和D-loop区序列估计群体间变异分别为-0.005％和0.44％,遗传分化系数(Fst)为-0.00045和0.00436,处于低程度分化(Fst＜0.05),两两群体间的遗传分化程度较低(Fst=-0.01158～0.01803),遗传交流多,为同一个遗传系谱,尤其是两湖之间存在共享单倍型,Fst均为负值,基因交流频繁,无遗传分化;喀啦额尔齐斯河(ER)与乌伦古河水系共4个群体基于CO Ⅰ基因估计群体间变异为1.57％,Fst为0.01568,但ER群体与WL群体处于中度遗传分化(Fst=0.06614＞0.05),ER与WR群体处于高度遗传分化(Fst=0.24627＞0.15),可能由于水坝的阻断,遗传资源得不到补充,喀啦额尔齐斯河形成了一个独立的遗传系谱.本研究结果可为新疆河鲈种群多样性保护以及种质资源开发利用提供参考.
文献关键词：
河鲈;新疆;线粒体;遗传结构
中图分类号：
作者姓名：
徐璞;鲁翠云;孙志鹏;霍堂斌;金洪宇;吴学工;郑先虎
作者机构：
上海海洋大学水产与生命学院,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海201306;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,淡水鱼类育种国家地方联合工程实验室,黑龙江哈尔滨150070
文献出处：
引用格式：
[1]徐璞;鲁翠云;孙志鹏;霍堂斌;金洪宇;吴学工;郑先虎-.基于线粒体序列的新疆4个河鲈野生群体的遗传现状分析)[J].中国水产科学,2022(07):980-993
A类：
fluviatilis,loop3
B类：
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AB值：
0.306041
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