典型文献
基于线粒体cytb和d-loop基因序列的东南沿海可口革囊星虫遗传多样性分析
文献摘要:
为了解中国东南沿海可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)自然群体的遗传多样性水平,探明该物种的种质资源情况,采用线粒体细胞色素b(cytb)基因和线粒体DNA控制区(d-loop)序列分析技术对广东湛江(ZJ)、广东阳江(YJ)、广西钦州(QZ)、福建宁德(ND)、浙江温州(WZ)5个可口革囊星虫自然群体进行测序分析.在150个样本中,cytb和d-loop序列分别检测到了118和158个多态位点,定义了62和79种单倍型.基于cytb和d-loop序列的遗传多样性参数分析均表现出较高的基因多样性(cytb:0.8713~0.9632;d-loop:0.9425~0.9816)和较低水平的核苷酸多样性(cytb:0.032487~0.040975;d-loop:0.033247~0.046151).而分子方差分析(AMOVA)结果一致表明,群体内部的遗传变异(cytb:98.56%;d-loop:98.61%)比例显著高于群体间的遗传变异(cytb:1.44%;d-loop:1.39%),表明可口革囊星虫在不同地理群体间的遗传变异并不明显,不同地理群体之间不存在地理隔离.单倍型邻接树的拓扑结构简单,未呈现明显的地理谱系结构.从Tajima's D和Fu's Fs检验结果显著偏离中性这一现象,可推测出可口革囊星虫群体近期经历过群体快速扩张事件.
文献关键词:
可口革囊星虫;遗传多样性;cytb;d-loop
中图分类号:
作者姓名:
许瑞雯;陈兴汉;余祥勇
作者机构:
阳江职业技术学院,广东阳江 529566;广东海洋大学,广东湛江 524088;华南农业大学,广州 510642
文献出处:
引用格式:
[1]许瑞雯;陈兴汉;余祥勇-.基于线粒体cytb和d-loop基因序列的东南沿海可口革囊星虫遗传多样性分析)[J].海洋渔业,2022(03):288-302
A类:
可口革囊星虫,革囊
B类:
cytb,loop,基因序列,遗传多样性分析,中国东南沿海,Phascolosoma,esculenta,种质资源,资源情况,体细胞,细胞色素,控制区,序列分析,湛江,ZJ,广东阳江,YJ,广西钦州,QZ,建宁,宁德,ND,温州,WZ,测序分析,多态位点,单倍型,遗传多样性参数,参数分析,核苷酸多样性,子方,AMOVA,群体内,遗传变异,群体间,不同地理群体,地理隔离,邻接,拓扑结构,结构简单,谱系结构,Tajima,Fu,Fs
AB值:
0.307844
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