典型文献
基于cox1序列的中国6个花鲈野生群体遗传多样性
文献摘要:
[目的]利用细胞色素C氧化酶1基因(cox1)序列片段研究中国6个花鲈(Lateolabrax maculatus)野生群体的遗传多样性和遗传结构.[方法]用PCR方法获得花鲈个体的cox1序列,测序后,用MEGA X、DnaSP 6.12和Arlequin 3.01等软件进行数据分析.[结果与结论]在6个花鲈群体229个样品共检测到48个多态性位点和50个单倍型.单倍型多样性为0.799~0.888,核苷酸多样性为0.001 6~0.002 7.6个花鲈群体遗传分化指数(Fst)为-0.008 1~0.1767.分子方差分析显示,遗传分化90.98%来自群体内,9.02%来自群体间.邻接系统进化树显示6个花鲈群体分为两大支.单倍型邻接树和单倍型网络关系图结果表明,未检测到有地理谱系结构的单倍型.中性检验显示,花鲈群体可能经历过种群扩张.
文献关键词:
花鲈;cox1序列;遗传多样性;遗传结构
中图分类号:
作者姓名:
范嗣刚;黄皓;王鹏飞;闫路路;赵超;张博;邱丽华
作者机构:
中国水产科学研究院南海水产研究所/广东省渔业生态环境重点实验室/农业农村部水产品加工重点实验室,广东 广州510300;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306
文献出处:
引用格式:
[1]范嗣刚;黄皓;王鹏飞;闫路路;赵超;张博;邱丽华-.基于cox1序列的中国6个花鲈野生群体遗传多样性)[J].广东海洋大学学报,2022(03):11-17
A类:
B类:
cox1,花鲈,野生群体,群体遗传,细胞色素,Lateolabrax,maculatus,遗传多样性和遗传结构,MEGA,DnaSP,Arlequin,多态性位点,单倍型多样性,核苷酸多样性,遗传分化,Fst,子方,群体内,群体间,邻接,系统进化树,网络关系,关系图,未检,谱系结构,中性检验,种群扩张
AB值:
0.394287
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