典型文献
DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性
文献摘要：
为了探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ、Ⅱ(COⅠ、COⅡ)和16SrRNA基因在鰤属鱼类物种鉴定和群体划分中的适用性,在黄条鰤(Seriola lalandi)、高体鰤(Seriola dumerili)、五条鰤(Seriola quinqueradiata)等鰤属鱼类中克隆了 3种基因,并进行序列比对与系统进化分析.结果显示,COⅠ、COⅡ和16SrRNA的基因序列均表现出明显的A+T偏倚性;16S rRNA序列最为保守,变异率仅为5.06％;CO Ⅰ序列的平均核苷酸差异数(k)和核酸多样性指数(Pi)高于CO Ⅱ和16S rRNA,CO Ⅱ的单倍型多样性指数最高,CO Ⅰ序列分化程度更高.比较了鰤属鱼类3种基因的扩增序列,发现COⅠ、CO Ⅱ和16S rRNA均能对我国分布的3种鰤属鱼类进行有效鉴别.另外,COⅠ、COⅡ还可作为不同地理群体黄条鰤的鉴别DNA条形码,而16S rRNA对于不同地理群体的黄条鰤辨识能力不足.在鰤属鱼类中,基于COⅠ、COⅡ、16S rRNA基因计算的种间遗传距离都大于种内遗传距离的10倍以上,系统进化分析显示每个物种都形成单系,表明COⅠ、COⅡ、16S rRNA基因不仅可作为鰤属鱼类物种鉴定和多样性保护的有效DNA条形码,CO Ⅰ、CO Ⅱ还可作为黄条鰤不同地理种群划分和国际资源判别的依据.
文献关键词：
鰤属鱼类;DNA条形码;遗传距离;系统进化树
中图分类号：
作者姓名：
王开杰;徐永江;柳学周;崔爱君;姜燕;王滨;方璐
作者机构：
中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛海洋科学与技术试点国家实验室深蓝渔业工程联合实验室,山东青岛266071;浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江舟山316022
文献出处：
引用格式：
[1]王开杰;徐永江;柳学周;崔爱君;姜燕;王滨;方璐-.DNA条形码在鰤属鱼类物种鉴定和系统进化分析中的适用性)[J].中国水产科学,2022(02):171-183
A类：
鰤属鱼类,五条鰤
B类：
条形码,物种鉴定,系统进化分析,体细胞,细胞色素,亚基,16SrRNA,黄条鰤,Seriola,lalandi,dumerili,quinqueradiata,序列比对,基因序列,A+T,偏倚性,异数,多样性指数,Pi,单倍型多样性,分化程度,国分,不同地理群体,种间,遗传距离,种内,种都,成单,单系,多样性保护,地理种群,国际资源,系统进化树
AB值：
0.257576
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