典型文献
基于TCGA和GEO数据库探讨VCAN基因及其甲基化在胃癌预后判断中的价值
文献摘要:
目的 探讨多功能蛋白聚糖基因(VCAN基因)表达和甲基化在胃癌患者预后判断中的价值.方法 通过生物信息学方法分析、研究了VCAN基因的表达及甲基化水平,以及其在预后和免疫方面的意义.此外,通过Meta分析验证VCAN基因在胃癌预后判断中的作用.结果 VCAN基因受到甲基化的负调控,导致其在胃癌组织中高表达.根据癌症基因组图谱(TCGA)数据库,VCAN基因表达和甲基化水平均与胃癌患者的总生存率(OS)和无进展生存率(PFS)有关.Meta分析显示,VCAN基因低表达与较高的生存率密切相关.VCAN基因的表达与某些免疫细胞或分子密切相关,尤其是CD4+T细胞、CD8+T细胞、CD2、CD3 D和CD3 E.结论 VCAN基因在胃癌免疫细胞的浸润中起着重要作用,并可作为一个潜在的胃癌预后生物标志物.
文献关键词:
多功能蛋白聚糖基因;胃癌;甲基化;存活;免疫细胞
中图分类号:
作者姓名:
张谦;梁鱼;安彩艳
作者机构:
内蒙古医科大学新药安全评价研究中心/内蒙古自治区新药筛选工程研究中心/内蒙古医科大学药学院,内蒙古呼和浩特 010110;内蒙古医科大学内蒙古临床医学院,内蒙古呼和浩特 010110;内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心,内蒙古呼和浩特 010050
文献出处:
引用格式:
[1]张谦;梁鱼;安彩艳-.基于TCGA和GEO数据库探讨VCAN基因及其甲基化在胃癌预后判断中的价值)[J].国际检验医学杂志,2022(04):388-393
A类:
多功能蛋白聚糖基因
B类:
TCGA,GEO,VCAN,预后判断,胃癌患者,生物信息学方法,甲基化水平,分析验证,负调控,胃癌组织,癌症基因组图谱,总生存率,OS,无进展生存率,PFS,低表达,免疫细胞,CD4+T,CD8+T,CD2,CD3,预后生物标志物
AB值:
0.209215
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