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核因子κB抑制物(IκB)家族在人肺腺癌中表达的生物信息学分析
文献摘要：
目的 生物信息学方法筛选核因子κB抑制物(IκB)家族基因在肺腺癌(LUAD)中的差异表达基因(DEG),探究其在LUAD中的临床意义.方法 采用R语言筛选出IκB家族基因的差异表达基因,并进行生存分析;R语言分析IκB家族基因表达与临床病理学特征的相关性;基于LinkedOmics对差异表达基因进行基因本体论(GO)富集、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集;肿瘤免疫评估资源(TIMER)分析差异表达基因与免疫细胞浸润的相关性;比例风险(COX)分析差异表达基因与LUAD预后的关系.结果 IκB家族中核因子κB抑制物δ(NFKBID)基因和核因子κB抑制物ζ(NFKBIZ)基因在LUAD组织中表达显著降低,且NFKBID和NFKBIZ低表达的LUAD患者具有更短的生存期;NFKBID、NFKBIZ与肺腺癌T分期显著相关;富集分析显示NFKBID、NFKBIZ可能参与能量代谢、蛋白质表达和运输;NFKBID、NFKBIZ的表达与B细胞、CD4+T细胞、中性粒细胞、树突状细胞(DC)的浸润呈正相关;COX分析提示NFKBIZ基因或可作为LUAD的独立预后因子.结论 NFKBID、NFKBIZ在LUAD组织中低表达,且患者生存期短;NFKBID、NFKBIZ可能通过调节糖代谢和多种免疫细胞浸润参与LUAD的发生发展;NFKBIZ可能是LUAD的独立预后因子.
文献关键词：
肺腺癌;核因子κB抑制物(IκB);生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
唐铭;杨杰;袁青;徐文峰;谢翔;于红
作者机构：
西南医科大学基础医学院,四川泸州646000
文献出处：
引用格式：
[1]唐铭;杨杰;袁青;徐文峰;谢翔;于红-.核因子κB抑制物(IκB)家族在人肺腺癌中表达的生物信息学分析)[J].细胞与分子免疫学杂志,2022(08):727-735
A类：
NFKBID
B类：
核因子,抑制物,肺腺癌,生物信息学分析,生物信息学方法,家族基因,LUAD,差异表达基因,DEG,生存分析,语言分析,临床病理学特征,LinkedOmics,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,肿瘤免疫,免疫评估,TIMER,免疫细胞浸润,COX,NFKBIZ,组织中表达,低表达,生存期,富集分析,能量代谢,蛋白质表达,CD4+T,树突状细胞,DC,预后因子,糖代谢
AB值：
0.209092
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