典型文献
基于生物信息学方法分析醛氧化酶1在急性淋巴细胞白血病患者中的表达及临床意义
文献摘要：
目的 考察醛氧化酶1(AOX1)在急性淋巴细胞白血病(ALL)中的表达,评估其作为ALL诊断、预后和甲氨蝶呤(MTX)敏感性生物标记物的潜力.方法 基于UCSC数据库下载ALL患者和正常人的RNA测序数据,分析AOX1基因在ALL组与正常组中的表达差异.自TARGET数据集获得ALL患者的总生存期(OS)数据,基于AOX1基因表达水平分为AOX1高表达组与低表达组,分析AOX1基因表达高低对ALL患者预后的影响.基于抗癌药物敏感性基因组学数据库预测MTX半数抑制浓度(IC50),分析AOX1基因表达与MTX敏感性的相关性.根据TARGET数据集的RNA测序数据中AOX1基因与N6-甲基腺嘌呤(m6 A)甲基化修饰基因表达的相关性,分析m6 A修饰在AOX1基因表达调控中的作用.结果 ALL组AOX1基因的阳性表达率93.18％(123例/132例),显著低于正常组98.22％(331例/337例,P<0.01),但2组AOX1基因的中位表达分别为-3.11和-3.05,差异无统计学意义(P=0.43).AOX1高表达组的中位生存时间(26.30个月)显著劣于低表达组(70.30个月,P<0.01).AOX1基因表达与MTX IC50显著负相关(r=-0.29,P<0.01),与多个m6 A修饰基因表达显著正相关.结论 AOX1基因在ALL中低表达,与ALL预后和MTX化疗敏感性显著相关,m6 A修饰可能是ALL中AOX1基因表达调控的机制之一.
文献关键词：
急性淋巴细胞白血病;醛氧化酶1;甲氨蝶呤;RNA修饰
中图分类号：
作者姓名：
李苗;孔晓岩;王淑梅
作者机构：
首都医科大学附属北京世纪坛医院,儿科,北京 100038;武警北京总队医院 药剂科,北京 100027;首都医科大学附属北京世纪坛医院,药学部,北京 100038
文献出处：
引用格式：
[1]李苗;孔晓岩;王淑梅-.基于生物信息学方法分析醛氧化酶1在急性淋巴细胞白血病患者中的表达及临床意义)[J].中国临床药理学杂志,2022(24):2946-2949
A类：
B类：
生物信息学方法,急性淋巴细胞白血病,白血病患者,AOX1,ALL,甲氨蝶呤,MTX,生物标记物,UCSC,下载,正常人,序数,表达差异,TARGET,总生存期,OS,基因表达水平,低表达,抗癌药物,药物敏感性,基因组学数据库,半数抑制浓度,IC50,N6,腺嘌呤,m6,甲基化修饰,基因表达调控,阳性表达率,低于正常,中位生存时间,劣于,化疗敏感性
AB值：
0.215884
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