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基于加权基因共表达网络分析探究桑树光合相关基因的调控模式
文献摘要：
基于前期桑树转录组数据和光合表型数据,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)共获得10个基因模块与表型关联,筛选到MEmagenta、MEgreen、MEyellow、MEpurple和MEblack光合相关基因模块.GO和KEGG分析显示,DEGs显著富集在光合相关酶活性、碳代谢和固碳等途径,筛选到12个与光合作用高度相关的基因.通过RNA-seq结合WGCNA分析,筛选了3个光合关键基因,即光系统Q(B)蛋白L484_000029基因、核糖二磷酸羧化酶L484_000836基因、核糖二磷酸羧化酶/加氧酶激活酶2 L484_025354基因.该结果为进一步研究桑树光合作用调控机理提供支持.
文献关键词：
加权基因共表达网络分析;桑树;光合相关基因
中图分类号：
作者姓名：
李勇;黄锦;于翠;莫荣利;朱志贤;董朝霞;胡兴明;邓文
作者机构：
湖北省农业科学院经济作物研究所,武汉 430064
文献出处：
引用格式：
[1]李勇;黄锦;于翠;莫荣利;朱志贤;董朝霞;胡兴明;邓文-.基于加权基因共表达网络分析探究桑树光合相关基因的调控模式)[J].湖北农业科学,2022(24):163-169
A类：
MEmagenta,MEgreen,MEyellow,MEpurple,MEblack,L484
B类：
加权基因共表达网络分析,分析探究,桑树,光合相关基因,调控模式,转录组数据,WGCNA,共获,表型关联,DEGs,碳代谢,固碳,光合作用,seq,关键基因,光系统,核糖,二磷酸,羧化酶,加氧酶,调控机理
AB值：
0.219841
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