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基于铁死亡基因结肠癌分子预后模型的建立与分析
文献摘要：
目的 分析结肠癌中铁死亡相关基因,构建基于铁死亡基因结肠癌分子预后模型.方法 在癌症基因图谱数据库中下载结肠癌转录组测序数据和患者临床信息.采用R 4.1.0软件获取结肠癌患者相应铁死亡相关基因的表达数据并进行差异基因分析.使用功能富集分析差异基因参与的生物学作用和功能.结合患者生存资料,采用COX回归分析筛选出与患者预后相关的基因,构建风险评分方程.根据风险评分将结肠癌患者分为高、低风险组.利用受试者工作特征曲线评价预后模型的灵敏度和特异度.结果 与正常组织比较,结肠癌组织中共有72个失调表达的铁死亡相关基因.差异基因主要参与了铁死亡及肿瘤相关信号通路.DRD4、TFAP2C、ENPP2、CAV14个铁死亡相关基因与患者预后相关(P<0.05),可用于风险预后模型的构建.与低风险组比较,高风险组患者总体生存率较差,差异有统计学意义(P<0.05).基于铁死亡基因结肠癌分子预后模型预测患者1、3、5年生存率的曲线下面积分别为0.714、0.750、0.759,具有较好的灵敏度和特异度.结论 基于铁死亡基因结肠癌分子预后模型成功构建,可较好地预测结肠癌患者的预后.
文献关键词：
结肠癌;铁死亡;预后;TCGA数据库;模型构建
中图分类号：
作者姓名：
黄奔;孙姗姗;王洁;赵鸿
作者机构：
南京医科大学第一附属医院 检验学部,江苏南京 210009;南京医科大学第一附属医院 放射科,江苏南京 210009
文献出处：
引用格式：
[1]黄奔;孙姗姗;王洁;赵鸿-.基于铁死亡基因结肠癌分子预后模型的建立与分析)[J].现代医药卫生,2022(24):4183-4189
A类：
ENPP2,CAV14
B类：
分子预后模型,中铁,铁死亡相关基因,癌症基因图谱数据库,下载,转录组测序,序数,临床信息,结肠癌患者,差异基因分析,使用功能,功能富集分析,生物学作用,COX,风险评分,评分方程,低风险组,受试者工作特征曲线,正常组织,结肠癌组织,肿瘤相关,DRD4,TFAP2C,高风险组,总体生存率,TCGA
AB值：
0.201509
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