典型文献
鹅产蛋性状全基因组选择信号分析
文献摘要：
[目的]利用选择信号分析方法在伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅中筛选与产蛋性状相关的候选基因.[方法]选取健康状况良好、饲养管理水平一致的2岁伊犁鹅母鹅和霍尔多巴吉鹅母鹅各24只,采集血液样本,提取基因组DNA,利用全基因组重测序技术进行选择信号检测分析,筛选出受到选择的候选区域,针对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选出与鹅产蛋性状相关的候选基因.[结果]全基因组重测序的平均测序深度为15.28×,与参考基因组比对率在97.31％以上.通过群体分化指数(Fst)对伊犁鹅和霍尔多巴吉鹅2个群体进行分析,共筛选到1 231个候选区域.与核昔酸多样性(Pi)进行联合分析后,伊犁鹅群体共筛选出10个候选区域,得到5个注释基因;霍尔多巴吉鹅群体中共筛选出353个候选区域,得到263个注释基因.GO功能和KEGG通路富集分析发现,初步筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因(BMP2、BMP6、MIS、ENO1、LIF、EP300),还发现了IL-18基因可能与禽类的免疫有关.[结论]本研究筛选出6个可能与鹅产蛋性状相关的候选基因,为揭示鹅产蛋性状的分子调控机制提供了参考.
文献关键词：
伊犁鹅;霍尔多巴吉鹅;选择信号;产蛋性状;候选基因
中图分类号：
作者姓名：
唐碧徽;潘璐;李海英;赵晓钰;吴盈萍;蒋腾;丁雅文;吴利楠;曹妍;梅志勇
作者机构：
新疆农业大学动物科学学院,乌鲁木齐830052
文献出处：
引用格式：
[1]唐碧徽;潘璐;李海英;赵晓钰;吴盈萍;蒋腾;丁雅文;吴利楠;曹妍;梅志勇-.鹅产蛋性状全基因组选择信号分析)[J].中国畜牧兽医,2022(08):3015-3025
A类：
伊犁鹅,霍尔多巴吉鹅
B类：
产蛋性状,全基因组选择,选择信号,信号分析,候选基因,状况良好,饲养管理,水平一,血液样本,全基因组重测序,信号检测,检测分析,候选区域,注释基因,通路富集分析,参考基因,群体分化,Fst,Pi,联合分析,鹅群,初步筛选,BMP2,BMP6,MIS,ENO1,LIF,EP300,禽类,分子调控机制
AB值：
0.218775
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