典型文献
不同生理阶段边鸡卵巢转录谱的构建及卵泡发育相关基因的分析
文献摘要：
本研究通过分析不同生理阶段边鸡卵巢转录表达谱,旨在找出与卵泡发育相关的基因并进行验证,以揭示边鸡就巢性强的遗传机制.构建代表不同生理期即70日龄(70 d,卵巢发育期)、165日龄(165 d,开产期)、220日龄(220 d,产蛋高峰期)和330日龄(330 d,就巢期)的边鸡卵巢基因表达谱,用转录组表达定量(RSEM)法对不同生理阶段边鸡卵巢基因表达进行相关性分析,通过基因差异表达、GO和KEGG分析筛选出与卵泡发育相关的候选基因,并应用实时定量PCR法对其表达进行验证.通过转录表达谱分析,共鉴定出18891个基因,已知基因有18063个,预测的新基因有828个;从转录表达谱中筛选出40个与卵泡发育相关的差异表达基因,其中,35个基因的表达量与发育卵泡数成正相关,FDX1L在70、220、165和330 d边鸡卵巢中表达量依次递减,NDRG4在70、165、220和330 d边鸡卵巢中表达量随日龄增加呈递减趋势,MC3R和PRLHR在70和330 d边鸡卵巢中表达量高于165和220 d的表达量;VIP仅在70、165和220 d边鸡卵巢中表达.随机取11个差异表达基因,经实时荧光定量PCR验证其相对表达量与转录表达谱一致;GO功能富集发现,差异表达基因主要集中在"生物过程",其次是"细胞组分",最后是"分子功能";KEGG分析发现,差异基因主要集中在信号转导、免疫系统和信号分子与相互作用通路中.本研究通过分析不同生理阶段边鸡卵巢基因表达谱,挖掘与卵泡发育相关的基因,通过GO功能富集和KEGG分析,获得了差异表达基因的功能分类和信号通路,为揭示边鸡卵泡发育相关基因的分子调控及其就巢性提供依据.
文献关键词：
边鸡;卵巢;转录组;差异表达基因;卵泡发育;就巢性
中图分类号：
作者姓名：
张俊珍;李彩娥;刘博;李建慧;张蒙;李亚莉;常强强
作者机构：
山西农业大学动物科学学院,太谷030801
文献出处：
引用格式：
[1]张俊珍;李彩娥;刘博;李建慧;张蒙;李亚莉;常强强-.不同生理阶段边鸡卵巢转录谱的构建及卵泡发育相关基因的分析)[J].畜牧兽医学报,2022(02):423-435
A类：
边鸡,FDX1L,MC3R,PRLHR
B类：
转录谱,卵泡发育,转录表达,就巢性,遗传机制,生理期,日龄,卵巢发育,发育期,开产,产期,产蛋,高峰期,就巢期,基因表达谱,转录组,表达定量,RSEM,基因差异表达,候选基因,实时定量,表达谱分析,新基因,差异表达基因,卵泡数,数成,巢中,NDRG4,呈递,VIP,相对表达量,功能富集,生物过程,差异基因,信号转导,免疫系统,信号分子,作用通路,功能分类,分子调控
AB值：
0.246228
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