典型文献
霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的基因组流行病学分析
文献摘要：
目的:研究多重耐药霍氏肠杆菌霍夫曼亚种临床分离株C37携带
blaNDM-1基因质粒的遗传特征，并对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组进行系统发育分析，以研究霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的全球流行情况。
方法:收集2014年8月至2021年8月中山大学附属第一医院分离的耐碳青霉烯阴沟肠杆菌复合物（CRECC）。采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术（MALDI-TOF MS）和16S rRNA Sanger测序对C37进行菌种鉴定。使用微量肉汤稀释法进行抗菌药物敏感性试验。采用聚合酶链反应（PCR）检测C37菌株携带的β内酰胺酶耐药基因和质粒介导的喹诺酮类耐药（PMQR）基因。使用接合试验确认C37菌株抗性基因的接合转移性。对C37菌株进行全基因组测序，提取霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组，对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种进行系统发育分析。结果:霍氏肠杆菌霍夫曼亚种C37菌株对三代头孢、碳青霉烯类、氨基糖苷类及喹诺酮类抗菌药物耐药，携带
blaACT-5、
blaNDM-1、
qnrA1、
aac（
6′）
-Ib-cr、
oqxAB、
fosA、
dfrA15等多种抗性基因及IncX3、IncX4、IncFIB和IncFII质粒。多位点序列分型（MLST）分析显示其属于阴沟肠杆菌复合体（ECC）ST78型。系统发育分析显示ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关。
结论:ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关，是传播碳青霉烯耐药基因的高风险克隆，需密切监测其流行情况。
文献关键词：
抗药性，微生物;霍氏肠杆菌霍夫曼亚种;肠杆菌，阴沟;碳青霉烯酶;分子流行病学
中图分类号：
作者姓名：
向国秀;马幸延;蔡依玫;余学高;谭坪海;徐彩霞;黄彬
作者机构：
中山大学附属第一医院医学检验科，广州 510080;大阪大学微生物病研究所，大阪530-0000;广东省中医院检验医学部，广州 510120;南方医科大学附属第二医院（珠江医院）血液内科，广州 510200;中山大学附属第一医院转化医学中心，广州 510080
文献出处：
引用格式：
[1]向国秀;马幸延;蔡依玫;余学高;谭坪海;徐彩霞;黄彬-.霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的基因组流行病学分析)[J].中华检验医学杂志,2022(09):943-949
A类：
霍氏肠杆菌霍夫曼亚种,基因组流行病学分析,CRECC,blaACT,qnrA1,dfrA15,ST78
B类：
多重耐药,临床分离株,C37,blaNDM,质粒,遗传特征,核心基因,系统发育分析,流行情况,中山大学,耐碳青霉烯,阴沟肠杆菌,复合物,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱,质谱技术,MALDI,TOF,16S,rRNA,Sanger,菌种鉴定,微量肉汤稀释法,抗菌药物敏感性试验,聚合酶链反应,内酰胺酶,耐药基因,PMQR,抗性基因,接合转移,转移性,全基因组测序,三代头孢,碳青霉烯类,氨基糖苷类,喹诺酮类抗菌药物,抗菌药物耐药,aac,Ib,cr,oqxAB,fosA,IncX3,IncX4,IncFIB,IncFII,多位点序列分型,MLST,复合体,碳青霉烯耐药,抗药性,碳青霉烯酶,分子流行病学
AB值：
0.214134
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