典型文献
基于全基因组分析的肺炎克雷伯菌耐药性与流行病学特征分析
文献摘要:
目的 了解肇庆市第二人民医院肺炎患者肺炎克雷伯菌(KP)分离株和医院环境KP分离株的病原学和分子流行病学特征.方法 对该医院2021年收集的49株肺炎患者KP分离株和2株医院环境KP分离株进行抗菌药物敏感性试验鉴定其耐药表型;全基因组测序确定其质粒、分子血清型、多位点序列分型(MLST)、毒力基因与耐药基因等分子特征;基于core?SNPs构建发育进化树,分析优势流行型菌株的进化特征.结果 感染KP的肺炎病患者大部分有基础病(87.76%),年龄>50岁(89.80%).51株KP耐药表型以耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)为主,存在优势耐药谱.携带的质粒主要为IncR、IncFⅡ(pHN7A8)和ColRNAⅠ,且IncFⅡ(pHN7A8)的pMLST为F33:A-:B-型.拥有优势分子血清型和MLST的菌株与优势耐药表型的菌株完全重合,为O2a K64?ST11 CRKP株.毒力基因和耐药基因显示,51株KP中2株菌株携带脲酶基因ureB.全部菌株携带耐药基因情况严重,且检测出10种不同亚型的β-内酰胺酶基因家族(bla CTX?M,bla ampC,bla OXA,bla LAP,bla KPC,bla LEN,bla SHV,bla SRT,bla TEM,bla OKP),优势流行型菌株均携带bla KCP?2基因.系统发育树结果显示有26株优势流行菌株与我国泸州、衡阳的分离株属于一 个克隆体,与北京、成都、巴黎的分离株属于一 个克隆群.结论 该医院感染KP的肺炎患者中存在一 种优势流行的强耐药克隆体菌株(O2aK64?ST11 CRKP),且该型菌株已经出现在院内和社区的相互散播趋势.
文献关键词:
肺炎克雷伯菌;医院内感染;毒力基因;耐药基因
中图分类号:
作者姓名:
熊流新;黄志伟;钟建辉;陆丽苗;梁启兰;潘朝勇;李淑英;苏乐斌
作者机构:
肇庆市第二人民医院检验科,广东肇庆526060;肇庆市第二人民医院重症监护室,广东肇庆526060;肇庆市疾病预防控制中心微生物检验科,广东肇庆526060
文献出处:
引用格式:
[1]熊流新;黄志伟;钟建辉;陆丽苗;梁启兰;潘朝勇;李淑英;苏乐斌-.基于全基因组分析的肺炎克雷伯菌耐药性与流行病学特征分析)[J].临床检验杂志,2022(08):582-588
A类:
pHN7A8,ColRNA,pMLST,O2a,ureB,LEN,OKP,O2aK64
B类:
全基因组分析,耐药性,流行病学特征分析,肇庆市,肺炎患者,分离株,医院环境,病原学,分子流行病学,抗菌药物敏感性试验,试验鉴定,耐药表型,全基因组测序,质粒,血清型,多位点序列分型,毒力基因,耐药基因,分子特征,core,SNPs,进化树,优势流,进化特征,基础病,耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌,CRKP,耐药谱,IncR,IncF,F33,全重,ST11,脲酶,酶基因,情况严重,不同亚型,内酰胺酶,基因家族,bla,CTX,ampC,OXA,LAP,KPC,SHV,SRT,TEM,KCP,系统发育树,流行菌株,泸州,衡阳,巴黎,医院感染,散播,医院内感染
AB值:
0.288578
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