典型文献
多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因组测序与同源性分析
文献摘要:
目的 分析多重耐药鲍曼不动杆菌(MDRAB)耐药基因和基因同源性,为临床合理使用抗菌药物、制定医院感染防控策略提供依据.方法 采用BD Phoenix?100全自动细菌鉴定及药敏分析仪对23株MDRAB进行鉴定及抗菌药物敏感性试验,用MALDI Biotyper全自动微生物质谱仪复核结果;利用Illumina HiSeq 4000系统进行全基因测序,使用glimmer3软件对基因组组装,使用tRNAscan?SE、RNAmmer和Rfam数据库对tRNA、rRNA和sRNA进行识别;根据菌株基因组序列,进行多位点序列分型(MLST),应用MEGA X version 10.1生物信息软件依据16S rDNA序列进行系统发育分析.结果 药敏结果显示,14种药物耐药率为100%,仅米诺环素和多黏菌素B耐药率低于50%;根据全基因测序技术分析耐药基因,共检出36种耐药基因,除ANT(3″)基因检出率为30.43%,Vibrio cholerae varG基因检出率为21.74%,AAC(6′)基因检出率为4.35%,其余均高于50%.blaOXA?23、blaOXA?66和blaADC?30耐药基因检出率为100%,blaTEM?1耐药基因检出率为95.7%,未检出blaSHV、blaIMP、blaVIM基因;MLST分型(Pasteur)分析结果显示23株菌株全部属于ST2一种序列分型,MLST分型(Oxford)分析结果显示23株菌株来自7个序列分型.系统发育分析显示23株菌和Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离近,而与醋酸钙不动杆菌进化距离远.但菌株18A独立为一支,其他22株菌与Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离更近.结论 我院检出的MDRAB对常用抗菌药物高度耐药,携带多种耐药基因,且菌株之间存在同源性,应加强院感防控.
文献关键词:
多重耐药鲍曼不动杆菌;全基因组测序;耐药基因;同源性
中图分类号:
作者姓名:
章志勇;李营;姜健阁;薛万华;边奕鑫
作者机构:
山东大学齐鲁医院德州医院 德州市人民医院检验科,山东德州253000;山东大学第二医院医学实验中心,济南250033
文献出处:
引用格式:
[1]章志勇;李营;姜健阁;薛万华;边奕鑫-.多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因组测序与同源性分析)[J].临床检验杂志,2022(11):849-852
A类:
glimmer3,RNAmmer,Rfam,varG,blaADC,Pasteur
B类:
多重耐药鲍曼不动杆菌,耐药基因组,同源性分析,MDRAB,医院感染防控,感染防控策略,BD,Phoenix,细菌鉴定,药敏分析,抗菌药物敏感性试验,MALDI,Biotyper,生物质谱,质谱仪,复核,Illumina,HiSeq,全基因测序,基因组组装,tRNAscan,SE,rRNA,sRNA,基因组序列,多位点序列分型,MLST,MEGA,version,生物信息软件,16S,rDNA,系统发育分析,药敏结果,药物耐药,耐药率,米诺环素,多黏菌素,基因测序技术,共检出,ANT,Vibrio,cholerae,AAC,blaOXA,blaTEM,未检,blaSHV,blaIMP,blaVIM,部属,ST2,Oxford,Acinetobacter,baumannii,strain,ATCC,进化距离,醋酸钙,距离远,18A,立为,我院,常用抗菌药物,院感防控,全基因组测序
AB值:
0.3676
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