典型文献
人蛋白质组芯片筛选宿主中与结核分枝杆菌Rv1705c相互作用的蛋白质
文献摘要：
目的:探究人体中与结核分枝杆菌(
Mycobacterium tuberculosis，
Mtb)Rv1705c蛋白相互作用的蛋白质。
方法:原核表达Rv1705c蛋白基因，收集包涵体，裂解后透析纯化Rv1705c并测定其浓度，ELISA法检测细菌Rv1705c刺激巨噬细胞后细胞因子IFN-γ的分泌量，使用纯化并带有生物素标记的Rv1705c孵育人蛋白质组芯片HuProt?，筛选与Rv1705c相互作用的人类蛋白质，使用GenePix Pro 6.0软件对蛋白质芯片的信号图像进行数据提取，使用GO、KEGG等多个数据库进行生物信息学分析，GST pulldown验证Rv1705c与PSMA3、RSAD2的相互作用。结果:纯化结果显示，Rv1705c在包涵体中表达，Rv1705c刺激巨噬细胞后IFN-γ分泌量显著上升。芯片结果显示共筛选出了29个与Rv1705c相互作用的潜在阳性蛋白质，其中PSMA3、NLN、THOP1、UPF3A、RSAD2、OMG、PNKD、STEAP3、MED8共9个蛋白质的信噪比(signal-to-noise ratio，SNR)>1.6。进一步的生物信息学分析发现候选蛋白PSMA3、RSAD2、C1QBP参与固有免疫应答激活信号转导，并且PSMA3、RSAD2与干扰素存在交互作用，GST pulldown验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c确有相互作用。结论:发现并验证PSMA3、RSAD2与Rv1705c存在相互作用，为
Mtb感染机制的研究提供参考。
文献关键词：
人蛋白质组芯片;Rv1705c;生物信息学;结核病
中图分类号：
作者姓名：
刘涛;洪文旭;邹小飞;桂静;傅钰;洪湘雅;叶春立
作者机构：
深圳市慢性病防治中心临床检验科，深圳 518020
文献出处：
引用格式：
[1]刘涛;洪文旭;邹小飞;桂静;傅钰;洪湘雅;叶春立-.人蛋白质组芯片筛选宿主中与结核分枝杆菌Rv1705c相互作用的蛋白质)[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(02):128-133
A类：
人蛋白质组芯片,Rv1705c,HuProt,GenePix,PSMA3,NLN,THOP1,UPF3A,PNKD,MED8,C1QBP
B类：
宿主,结核分枝杆菌,Mycobacterium,tuberculosis,Mtb,蛋白相互作用,原核表达,包涵体,巨噬细胞,IFN,分泌量,生物素标记,孵育,类蛋白质,蛋白质芯片,信号图像,数据提取,生物信息学分析,GST,pulldown,RSAD2,OMG,STEAP3,signal,noise,ratio,SNR,固有免疫应答,信号转导,干扰素,确有,感染机制,结核病
AB值：
0.199897
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