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间充质干细胞调控的慢加急性肝衰竭小鼠肝脏转录组景观
文献摘要：
目的 通过检测和分析间充质干细胞(MSC)治疗的慢加急性肝衰竭(ACLF)小鼠肝脏转录组学,探究重要差异基因集合及其生物学效应.方法 使用生理盐水或MSC治疗四氯化碳诱导的ACLF小鼠.转录组测序获得肝脏差异表达基因(DEGs).进行功能富集分析、蛋白相互作用网络分析、免疫浸润分析及加权基因共表达网络分析.最终构建枢纽基因与表型网络.结果 经或未经MSC治疗的ACLF小鼠肝脏(n=6)表达谱显示出584个DEGs(lg|FC|≥3,Q≤0.05).DEGs主要富集在钙信号、细胞因子-细胞因子受体相互作用和白细胞介素-17(IL-17)信号等通路(Q≤0.05).鉴定出一个以IL-6为中心的含41个基因的免疫调控网络,其与肝脏巨噬细胞(Spearson cor=0.496)、中性粒细胞(Spearson cor=-0.421)、滤泡辅助 T 细胞(Spearson cor=0.401)和辅助性 T 细胞 17(Th17)(Spearson cor=-0.342)比例变化相关.共表达的DEGs分为7个模块(|Pearson cor|≥0.8,Q≤0.05),功能主要为调控细胞增殖、免疫与炎症、氧化还原过程、糖脂代谢等.结论 本研究揭示了参与MSC阻断ACLF进展的候选枢纽基因和通路,为全面地了解MSC治疗ACLF的分子机制提供帮助.
文献关键词：
慢加急性肝衰竭;间充质干细胞;二代测序;转录组学;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
张静;李智辉;王嘉蕾;林登娜;熊静;陈俊峰;林炳亮
作者机构：
中山大学附属第三医院感染性疾病科,广东广州510630
文献出处：
引用格式：
[1]张静;李智辉;王嘉蕾;林登娜;熊静;陈俊峰;林炳亮-.间充质干细胞调控的慢加急性肝衰竭小鼠肝脏转录组景观)[J].热带医学杂志,2022(09):1179-1184,封2
A类：
B类：
间充质干细胞,细胞调控,慢加急性肝衰竭,小鼠肝脏,肝脏转录组,MSC,ACLF,转录组学,差异基因,生物学效应,生理盐水,四氯化碳诱导,转录组测序,差异表达基因,DEGs,功能富集分析,蛋白相互作用网络分析,免疫浸润,加权基因共表达网络分析,枢纽基因,表达谱,lg,FC,钙信号,细胞因子受体,免疫调控,调控网络,巨噬细胞,Spearson,cor,滤泡,辅助性,Th17,氧化还原,还原过程,糖脂代谢,二代测序
AB值：
0.253411
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