典型文献
进境玉米种子中小麦花叶病毒的检测及其RNA3序列全长扩增分析
文献摘要：
小麦花叶病毒(wheat mosaic virus,WMoV)是严重危害小麦、玉米等禾本科作物的种传病毒,在我国尚无发生,具有重要检疫意义.本研究利用引物WMoV-283F/R全国首次检测出玉米种子中的WMoV,成功扩增出了两个不同典型毒株NP序列,并分析其序列特征.根据WMoV-RNA3、WMoV-RNA3A和WMoV-RNA3B序列特点设计特异性引物,经RT-PCR扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA,扩增产物测序得到283 bp基因序列,分别与WMoV分离物GG1-RNA3B(GenBank登录号KT988872.1)、WMoV分离物K1-RNA 3(GenBank登录号KT988889.1)同源性为96.11％、96.47％.设计引物分别扩增玉米种子样品2211-2和8044-10的RNA核衣壳全长序列,得到WMoV-Germany RNA3、WMoV-Malaysia RNA3A和WMoV-Malaysia RNA3B全长序列.使用MEGA6软件采用Maximum likelihood法建立系统发育树,它们分别属于3个同源性差异明显的簇.通过DNAMAN序列比对分析三者的关系,RNA3序列在标尺碱基位点220～506区域序列差异性最大,而序列700～892、972～1102区段则相对保守.这为检测引物的设计提供了重要参考.WMoV的首次截获并鉴定为该病毒的检测鉴定和致病机理研究提供依据.
文献关键词：
小麦花叶病毒;进境玉米种子;RT-PCR检测;序列分析;系统发育树
中图分类号：
作者姓名：
田沂民;俞禄珍;易建平;王书平;印丽萍;于翠
作者机构：
上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 上海200135
文献出处：
引用格式：
[1]田沂民;俞禄珍;易建平;王书平;印丽萍;于翠-.进境玉米种子中小麦花叶病毒的检测及其RNA3序列全长扩增分析)[J].植物检疫,2022(01):34-38
A类：
进境玉米种子,小麦花叶病毒,WMoV,283F,RNA3A,RNA3B,GG1,KT988872,KT988889
B类：
全长,wheat,mosaic,virus,严重危害,禾本科作物,检疫,研究利用,毒株,NP,序列特征,特异性引物,子样,扩增产物,bp,基因序列,分离物,GenBank,登录号,K1,同源性,衣壳,Germany,Malaysia,MEGA6,Maximum,likelihood,建立系统,系统发育树,DNAMAN,序列比对,比对分析,标尺,碱基,序列差异,区段,截获,检测鉴定,致病机理,序列分析
AB值：
0.225004
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