为分析青鱼线粒体蛋白编码基因与体色性状的相关性,筛选出与体色相关的SNP分子标记.本研究选取了5尾广东佛山灰色青鱼和5尾扬州邗江正常体色黑色青鱼的皮肤组织,通过qPCR检测13个线粒体蛋白质编码基因在2种颜色群体皮肤组织中的相对表达量,进行显著性分析.对表达差异最明显的蛋白编码基因CDS区设计引物,并选取78尾佛山灰色青鱼样本和92尾邗江黑色青鱼样本进行测序,根据测序峰图筛选出SNP位点.结果显示,13个线粒体蛋白质编码基因中,COⅡ基因相对表达量最高,ND5基因最低,ND4L基因在两种体色青鱼中的表达差异最为明显.在170尾青鱼线粒体ND4L基因上共检测到了2个SNP位点C252T和A243G.佛山灰色群体A243G位点的A、G基因型频率为96.2％、3.8％,C252T位点的T、C基因型频率为38.5％、61.5％.邗江正常体色群体C252T位点的A、G基因型频率为100％、0％,C252T位点的T、C基因型频率为15.2％、84.8％.共检测到3种单倍型AC、AT、GC,AC频率最高,AC和AT在两种体色中均有分布,GC频率最低,仅在正常体色中出现.本实验研究了与青鱼体色相关的线粒体ND4L基因上2个SNP位点的基因型和单倍型的分布情况,为青鱼的体色和生长研究以及青鱼的育种工作提供理论指导.

青鱼;线粒体;ND4L基因;体色;SNP位点

毛思琦;鲍生成;徐晓雁;李家乐;沈玉帮

上海海洋大学,农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306;上海海洋大学,上海水产养殖工程技术研究中心,上海 201306

水产学报

[1]毛思琦;鲍生成;徐晓雁;李家乐;沈玉帮-.青鱼线粒体ND4L的SNP筛选及在两种体色群体中的分布)[J].水产学报,2022(12):2257-2264

ND4L,C252T,A243G

青鱼,鱼线,SNP,蛋白编码,色相,分子标记,佛山,扬州,邗江,皮肤组织,qPCR,蛋白质编码基因,种颜色,显著性分析,表达差异,CDS,引物,基因相对表达量,ND5,基因型频率,单倍型,AC,AT,鱼体色,育种工作

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