单核苷酸多态性分子标记(single nucleotide polymorphism,SNP)是目前常用的分子标记辅助育种的工具之一.本研究在前期构建的青鱼(Mylopharyngodon piceus)高密度连锁图谱和QTL定位结果的基础上,利用体质量QTL区间中的2个SNP标记在3个青鱼群体中进行验证,目的是为了检测通过QTL定位得到的SNP是否存在并能应用于其他地理群体,利用对分子标记的侧翼序列进行基因型组成分析、遗传多样性分析及中性检验等方法,对3个群体的2个SNP侧翼序列进行分析.遗传多样性结果显示,snp8107的扩展片段的单倍型多样性(Hd)在邗江群体、湘江群体和石首群体中分别为0.782、0.515和0.497;各位点的观测杂合度(H0)为0.067～0.533,平均为0.239;期望杂合度(He)为0.127～0.506,平均为0.306;多态信息含量(PIC)为0.117～0.374,平均为0.246.中性检验显示3个群体在历史上可能发生过瓶颈效应导致稀有等位基因丢失的现象,结合遗传多样性结果推测,邗江群体在经历瓶颈效应后保留下来的稀有等位基因更多,最终得出结论邗江群体是适合进行遗传改良的最优群体.

青鱼;SNP;遗传多样性;中性检验

郭加民;徐晓雁;李家乐;沈玉帮

上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室,上海 201306;上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心,上海 201306;上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心,上海 201306

上海海洋大学学报

[1]郭加民;徐晓雁;李家乐;沈玉帮-.青鱼生长相关SNP标记在不同地理群体中的验证)[J].上海海洋大学学报,2022(05):1089-1096

snp8107,首群

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