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2种带鱼科鱼类线粒体COI基因片段的比较分析
文献摘要：
为探究2种带鱼科鱼类的遗传差异,对带鱼和沙带鱼线粒体细胞色素c氧化酶亚基I(cytochrome c oxidase sub-unit I,COI)基因进行扩增.通过测定得到长度为550 bp的基因片段,无碱基的插入和缺失,A、T、G、C碱基中G含量最低,A+T平均含量(52.93％)高于G+C含量(47.07％).碱基转换明显大于颠换,转换与颠换比(R)平均为2.72,且密码子第1位点碱基突变数目明显高于其它位点.28尾沙带鱼样品中检测到12种单倍型,24尾带鱼样品中检测到13种单倍型,前者平均单倍型多样度(Hd)及核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.716 9和0.005 0,后者分别为0.884 1和0.004 6.采用Kimura双参数法计算种间平均遗传距离为0.165 5,远大于种内个体间平均遗传距离.基于单倍型构建的邻接系统发育树显示2种鱼类得到很好的区分,从进化关系上来看,沙带鱼分化时间较带鱼更早.
文献关键词：
带鱼;沙带鱼;线粒体COI基因;序列比较
中图分类号：
作者姓名：
斯舒谨;褚梦洁;袁帆;王忠明;杨天燕;朱文斌
作者机构：
浙江海洋大学水产学院,浙江舟山 316022;浙江海洋大学海洋与渔业研究所,浙江省海洋水产研究所,浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室,农业农村部重点渔场渔业资源科学观测实验站,浙江舟山 316021
文献出处：
引用格式：
[1]斯舒谨;褚梦洁;袁帆;王忠明;杨天燕;朱文斌-.2种带鱼科鱼类线粒体COI基因片段的比较分析)[J].浙江海洋大学学报（自然科学版）,2022(01):7-14
A类：
沙带鱼
B类：
鱼科,鱼类,COI,遗传差异,鱼线,体细胞,细胞色素,亚基,cytochrome,oxidase,sub,unit,bp,A+T,G+C,密码子,碱基突变,变数,单倍型,Hd,核苷酸多样性,多样性指数,Pi,Kimura,双参数,参数法,种间,遗传距离,远大于,种内,邻接,系统发育树,进化关系,系上,分化时间,更早,序列比较
AB值：
0.388793
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