首站-论文投稿智能助手
典型文献
鳙bmi1b基因单核苷酸多态性及其与生长和体型性状的关联性
文献摘要:
bmi1b基因作为转录抑制因子,在维持多种干细胞的自我更新和增殖活性方面起重要作用.本研究对鳙(Hypophthalmichthys nobilis)bmi1b基因进行了单核苷酸多态性发掘及其与生长和体型性状的关联性分析.鳙bmi1b全长5800 bp,包含9个外显子、8个内含子,其氨基酸序列在进化上较为保守.bmi1b在鳙下丘脑和肝脏中的表达量较高,胚胎发育阶段从未受精卵至囊胚期都有极高的表达,原肠期后表达量显著降低,具有母源基因的表达特征.采用PCR扩增产物直接测序的方法,在鳙bmi1b 3'UTR获得2个SNPsg.5224 T>A和g.5550 C>T.利用来源于1个鳙混合群体的169尾鱼进行SNP基因分型及其与生长和体型性状的相关性分析,结果表明:g.5224 T>A与体重和头高呈显著相关(P<0.05),与体高和头长呈极显著相关(P<0.01);g.5550 C>T与体重和体型性状的相关性未达到显著水平.2个SNP位点等位基因间的组合分析显示,双倍型D2(AT CC)为优势基因型组合,其体重和体型性状的平均值显著高于其他双倍型.这些结果为进一步研究鱼类bmi1b基因的功能提供了参考;同时鳙bmi1b基因SNP标记在生长和体型性状的分子育种研究中也具有良好的应用潜力.
文献关键词:
鳙;bmi1b;单核苷酸多态性;生长性状;体型;关联性分析
作者姓名:
高一凡;俞小牧;桂建芳;童金苟
作者机构:
大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023;淡水生态与生物技术国家重点实验室,湖北洪山实验室,中国科学院种子创新研究院,中国科学院水生生物研究所,湖北武汉430072
文献出处:
引用格式:
[1]高一凡;俞小牧;桂建芳;童金苟-.鳙bmi1b基因单核苷酸多态性及其与生长和体型性状的关联性)[J].中国水产科学,2022(04):503-514
A类:
bmi1b,SNPsg
B类:
单核苷酸多态性,体型性状,转录抑制,抑制因子,自我更新,增殖活性,Hypophthalmichthys,nobilis,关联性分析,全长,bp,外显子,内含子,氨基酸序列,下丘脑,胚胎发育,发育阶段,从未,受精卵,囊胚,表达特征,扩增产物,直接测序,UTR,合群,基因分型,显著水平,等位基因,组合分析,双倍,D2,AT,CC,基因型,鱼类,分子育种,育种研究,生长性状
AB值:
0.294207
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。