典型文献
马氏珠母贝PEPCK基因序列特征及其在耐低温品系的选择印记分析
文献摘要：
磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(phosphoenolpyruvate carboxykinase,PEPCK)是糖异生途径的关键酶,当动植物处于温度胁迫等不良环境条件时,它可通过催化草酰乙酸转化为磷酸烯醇式丙酮酸,继而生成葡萄糖以维持机体的血糖平衡,在抗逆过程中起着重要作用.本研究鉴定了马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)的PEPCK基因(PmPEPCK),分析了低温胁迫下PmPEPCK表达量的变化,筛选和比较分析了马氏珠母贝耐低温选育系(low tem-perature resistant line,R)F3和北部湾野生群体(Beibu Gulf wild population,W)的 PmPEPCK 外显子区的 SNP 位点.序列分析表明,PmPEPCK基因全长2557 bp,5'UTR和3'UTR分别为56 bp和446 bp,开放阅读框2055 bp,编码684个氨基酸.PmPEPCK在所检测组织中均有表达,其中肝胰腺表达量最高(P＜0.05).低温胁迫后鳃组织中的时序表达结果显示,低温组(12℃、17℃)PmPEPCK的表达量在6 h达到最高,显著高于22℃对照组(P＜0.05),说明PmPEPCK参与贝体的低温响应过程.对PmPEPCK的外显子区SNP进行分析,共得到108个SNP,其中47个SNP位点的基因型频率在R和W群体间差异显著(P＜0.05),仅在R中被检测到的基因型有11个,分别是位点g.60010420、g.60007411、g.60011365的基因型 AG,位点 g.60006265、g.60006166的基因型 AA,位点 g.60007389、g.60011387的基因型 CT 和 g.60009449、g.60006028的基因型 TT,位点 g.60011341 的基因型 GG 和 g.60009464的基因型GT.结论认为经过3代选育后,R群体的PmPEPCK基因受到了强烈的正选择,PmPEPCK的这些SNPs及其基因型可能与选育系的低温耐受能力相关,并可能作为选择育种的候选标记.
文献关键词：
马氏珠母贝;PEPCK;低温耐受;SNP;基因克隆
中图分类号：
作者姓名：
陈琨;赖卓欣;刘雅;郝瑞娟;王庆恒
作者机构：
广东海洋大学水产学院,广东湛江524088;南方海洋科学与工程广东省实验室,广东湛江524025;广东省珍珠科技创新中心,广东湛江524088
文献出处：
引用格式：
[1]陈琨;赖卓欣;刘雅;郝瑞娟;王庆恒-.马氏珠母贝PEPCK基因序列特征及其在耐低温品系的选择印记分析)[J].中国水产科学,2022(01):58-69
A类：
PmPEPCK
B类：
马氏珠母贝,基因序列特征,耐低温,品系,印记,记分,烯醇,丙酮酸,phosphoenolpyruvate,carboxykinase,糖异生,关键酶,动植物,温度胁迫,不良环境,草酰乙酸,血糖平衡,抗逆,Pinctada,fucata,martensii,低温胁迫,选育系,low,tem,perature,resistant,line,F3,北部湾,野生群体,Beibu,Gulf,wild,population,外显子,子区,序列分析,全长,bp,UTR,开放阅读框,肝胰腺,时序表达,低温响应,响应过程,基因型频率,群体间差异,AG,AA,TT,GG,GT,正选择,SNPs,低温耐受,耐受能力,选择育种,基因克隆
AB值：
0.377611
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