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2015-2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒分子流行病学特征分析
文献摘要:
目的 分析2015-2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒的分子流行病学特征.方法 收集2015年1月1日-2018年12月31日期间北京市东城区流感样病例的咽拭子样本,RT-PCR法检测核酸,阳性样本接种至MDCK细胞进行病毒分离,血凝抑制试验鉴定流感亚型.选取30株甲型H1N1pdm09亚型分离株,RT-PCR法扩增血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因序列,并测序.应用DNASTAR 5.0软件将HA、NA序列进行拼接,MEGA 6.0软件建立系统进化树,并进行遗传特征分析.结果 共检测样本7 533份,甲型H1N1pdm09亚型231份,阳性率为23.24%.30株甲型H1N1pdm09亚型分离株与WHO推荐的北半球疫苗株A-Brisbane-02-2018的HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.42%~99.53%和97.40%~99.32%;NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为98.11%~99.74%和97.72%~99.80%.HA基因共有16个氨基酸位点发生改变,NA基因共有10个位点发生改变;抗原受体结合位点、糖基化位点和耐药位点均未发生改变.结论 2015-2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒HA和NA基因位点发生了一些变异,但抗原性和耐药性未发生改变,与疫苗株匹配性较高.本研究为北京市东城区评价疫苗保护效果及制定流感防治措施提供了实验依据.
文献关键词:
流感病毒;甲型H1N1pdm09亚型;血凝素;神经氨酸酶;流行病学特征
中图分类号:
作者姓名:
李艳宇;李姗姗;杜嘉鑫;韩营营
作者机构:
北京市东城区疾病预防控制中心微生物检验科,北京东城100050
文献出处:
引用格式:
[1]李艳宇;李姗姗;杜嘉鑫;韩营营-.2015-2018年北京市东城区甲型H1N1pdm09亚型流感病毒分子流行病学特征分析)[J].中国生物制品学杂志,2022(09):1076-1081,1089
A类:
H1N1pdm09
B类:
北京市东城区,甲型,流感病毒,分子流行病学,流行病学特征分析,流感样病例,咽拭子,子样本,阳性样本,MDCK,病毒分离,血凝抑制试验,试验鉴定,分离株,血凝素,hemagglutinin,HA,神经氨酸酶,neuraminidase,基因序列,DNASTAR,拼接,MEGA,建立系统,系统进化树,遗传特征分析,检测样本,WHO,北半球,疫苗株,Brisbane,氨基酸序列,序列同源性,氨基酸位点,个位,抗原受体,结合位点,糖基化位点,基因位点,抗原性,耐药性,匹配性,疫苗保护效果
AB值:
0.273244
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