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典型文献
北京市2021—2022年流行季首起乙型流感疫情的血凝素基因分析
文献摘要:
目的:分析2021—2022年流行季北京市首起乙型流感Victoria系(BV)疫情的病毒血凝素(HA)的基因变异和进化特征以及与流感疫苗株的匹配性。方法:采集北京市朝阳区某小学乙型流感疫情流感样病例的咽拭子标本,提取核酸后利用二代测序技术进行测序分析。应用BioEdit分析HA基因的核苷酸和氨基酸变异位点,采用Mega 6.0软件中的NJ模式构建HA基因的遗传进化树并分析。结果:通过二代测序获得了2株BV的HA基因全长序列。与本年度的疫苗株HA基因相比较,疫情株有9个氨基酸位点发生变异,其中6个变异位点位于3个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示疫情株HA基因位于Clade 1A.3a2分支,与2021—2022年度北半球推荐的流感疫苗株(B/Washington/02/2019)不在同一分支。结论:本起BV疫情毒株的HA基因在抗原表位发生多处变异,必需加强BV流感的监测与变异规律分析,为BV防控策略的制定提供有力的数据支撑。
文献关键词:
二代测序;乙型流感病毒;HA基因;基因变异
作者姓名:
刘医萌;潘阳;彭晓旻;赵佳琛;石伟先;冯兆民;徐晖;卢桂兰;张代涛;杨鹏;王全意
作者机构:
北京市疾病预防控制中心 传染病地方病控制所 100013
文献出处:
引用格式:
[1]刘医萌;潘阳;彭晓旻;赵佳琛;石伟先;冯兆民;徐晖;卢桂兰;张代涛;杨鹏;王全意-.北京市2021—2022年流行季首起乙型流感疫情的血凝素基因分析)[J].国际病毒学杂志,2022(02):142-145
A类:
3a2
B类:
首起,血凝素,基因分析,Victoria,BV,毒血,HA,基因变异,进化特征,流感疫苗,疫苗株,匹配性,北京市朝阳区,流感样病例,咽拭子,二代测序技术,测序分析,BioEdit,氨基酸变异,变异位点,Mega,NJ,模式构建,遗传进化树,基因全长序列,本年度,氨基酸位点,抗原决定簇,进化树分析,Clade,1A,北半球,Washington,毒株,抗原表位,多处,变异规律,规律分析,防控策略,乙型流感病毒
AB值:
0.354534
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