典型文献
海南文心兰切花品种病毒病的分子鉴定
文献摘要：
[目的]文心兰切花产业占我国70％ 的市场,已经成为海南省重要的热带花卉支柱产业之一.文心兰生长过程中易受病毒的侵染,严重影响其植株生长、叶片发育、花形花色,同时降低其观赏价值,开展海南文心兰切花品种叶片病毒病的系统性分子鉴定有助于病害防治.[方法]本研究以海口、文昌、乐东、三亚、五指山、保亭、琼海、儋州8个主产区县市采集的12个品种共178份文心兰疑似病毒感染样品为试验材料,通过RT-PCR及小RNA(sRNA)深度测序技术进行病原分子鉴定,克隆其CP基因并进行生物信息学分析.[结果]1)海南文心兰疑似病毒感染样品叶片呈现褪绿状斑或条纹、黄化雾状斑、皱缩、黑色坏色斑等症状,且不同品种间存在差异,主要侵染病毒为建兰花叶病毒(Cymbidium mosaic virus,CymMV)和齿兰环斑病毒(Odontoglossum ringspot virus,ORSV);2)建兰花叶病毒海南分离物CymMV-HN和齿兰环斑病毒海南分离物ORSV-HN的CP基因核酸序列长度分别为672和477 bp,编码223和158个氨基酸,与已报道的病毒CP基因序列具有较高的同源性,表明在进化过程中具有较高的保守性;3)sRNA深度测序共获得26976941条raw reads,过滤后得到26039391条clean reads,拼接后获得1256个Contigs,在Nr等数据库中共同注释到66个contigs,在CymMV和ORSV基因组数据库中分别注释到56和39个contigs,表明海南文心兰病毒病主要由CymMV和ORSV侵染而导致.[结论]CymMV和ORSV是海南文心兰感病的主要病毒类型.
文献关键词：
海南文心兰;病毒;RT-PCR;CP基因;sRNA深度测序
中图分类号：
作者姓名：
闫钟荣;谢承智;宋希强;王洪星
作者机构：
海南大学 海南省热带特色花木资源生物学重点实验室,海南海口 570228;海南大学 林学院,海南海口 570228
文献出处：
引用格式：
[1]闫钟荣;谢承智;宋希强;王洪星-.海南文心兰切花品种病毒病的分子鉴定)[J].中南林业科技大学学报,2022(11):53-62
A类：
海南文心兰,Odontoglossum
B类：
切花品种,病毒病,分子鉴定,海南省,热带花卉,支柱产业,生长过程,中易,受病,侵染,植株生长,叶片发育,花色,观赏价值,病害防治,海口,文昌,乐东,三亚,五指山,保亭,琼海,儋州,主产区,区县,县市,sRNA,深度测序,CP,生物信息学分析,条纹,黄化,雾状,皱缩,色斑,不同品种,种间,建兰花叶病毒,Cymbidium,mosaic,virus,CymMV,齿兰环斑病毒,ringspot,ORSV,分离物,HN,bp,基因序列,同源性,保守性,共获,raw,reads,clean,拼接,Contigs,Nr,contigs,基因组数据,病毒类型
AB值：
0.324388
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