典型文献
藜麦NHX基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析
文献摘要：
探讨藜麦NHX基因家族生物学特性及盐胁迫下的表达模式,以期为藜麦抗盐品种选择提供理论依据.以藜麦含有Na+/H+exchange结构域的蛋白质序列为基础,对其基因结构、蛋白质motif、理化性质以及盐胁迫下转录表达进行分析.结果表明,藜麦基因组中含有46个NHXs基因家族成员,氨基酸长度为109-1820 aa,分子质量为11472.74-204381.38 Da,等电点为5.00-9.27,亲水性为-0.226-1.112,不稳定指数为21.71-50.73.进化树分析可以将其分为5个亚组,在进化树中位置相近的NHXs基因具有相近的结构.同一亚组的NHXs蛋白具有相似motif结构,与拟南芥、小麦和玉米为直系同源蛋白,且多数定位在细胞膜和液泡中.通过盐胁迫下藜麦转录组数据分析发现,随盐胁迫时间增加,其中有26个NHXs基因的转录水平提升,9个下降,11个无明显变化.此外,35个受到盐胁迫诱导表达的NHXs基因,通过GO注释发现,主要参与离子、细胞稳态和离子跨膜运输过程.NHXs基因结构和蛋白质motif的多样性,推测不同亚组NHXs在盐胁迫中参与不同的响应过程,其盐胁迫下不同的表达模式也表明在盐胁迫响应过程中发挥重要作用.
文献关键词：
藜麦;NHX基因家族;基因结构;motif;理化性质;盐胁迫;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
张业猛;朱丽丽;陈志国
作者机构：
中国科学院大学,北京 100049;中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所,西宁 810001;青海省作物分子育种重点实验室,西宁 810001
文献出处：
引用格式：
[1]张业猛;朱丽丽;陈志国-.藜麦NHX基因家族鉴定及盐胁迫下表达分析)[J].生物技术通报,2022(12):184-193
A类：
H+exchange,NHXs
B类：
藜麦,基因家族鉴定,盐胁迫,表达分析,生物学特性,表达模式,抗盐,品种选择,Na+,结构域,蛋白质序列,基因结构,motif,转录表达,aa,分子质量,Da,等电点,亲水性,进化树分析,拟南芥,小麦和玉米,直系,同源蛋白,细胞膜,液泡,转录组数据,转录水平,诱导表达,细胞稳态,跨膜运输,运输过程,响应过程,胁迫响应
AB值：
0.273244
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