典型文献
甜菜BvHAK基因家族全基因组鉴定及其在盐处理下的表达分析
文献摘要：
高亲和性K+转运蛋白(high-affinity K+transporter,HAK)是植物中最重要的K+转运蛋白家族之一,在植物K+吸收和转运过程中发挥重要功能.为探究甜菜BvHAK基因家族成员生物学功能及基因表达模式,采用生物信息学手段,预测了蛋白质的理化性质、基因结构、染色体定位、系统进化、保守基序、三维结构、互作网络、启动子顺式作用元件,并通过qRT-PCR分析了盐胁迫下BvHAKs基因在甜菜不同组织中的表达水平.共鉴定出10个甜菜BvHAK基因家族成员,含有8-10个外显子、7-9个内含子;平均氨基酸个数为778.30,平均分子量为88.31 kDa,等电点为5.38-9.41,跨膜区为11-14个.BvHAK4.-5、-7和-13定位在质膜,而其余定位在液泡膜.系统进化分析发现,高等植物HAK可分为5个簇,分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ簇,其中Ⅱ簇成员可进一步分为Ⅱa、Ⅱb和Ⅱc等3个亚簇;BvHAK家族成员则分布在前4簇,分别含有1、6、1和2个成员.甜菜BvHA K基因家族主要含有胁迫响应元件、激素响应元件和生长发育响应元件.进一步对BvHAK基因在盐处理下甜菜不同组织中的表达模式分析发现,50和100 mmol/L NaCl不同程度地诱导甜菜地上部和根部BvHAK基因家族成员的表达;高盐(150 mmol/L)则下调了其在地上部的表达水平.这些结果表明,BvHAK基因家族在响应盐胁迫过程中起重要作用.
文献关键词：
甜菜;高亲和性K+转运蛋白;HAK基因家族;顺式作用元件;耐盐性
中图分类号：
作者姓名：
杨小涵;伍国强;魏明;王北辰
作者机构：
兰州理工大学生命科学与工程学院,甘肃兰州730050
文献出处：
引用格式：
[1]杨小涵;伍国强;魏明;王北辰-.甜菜BvHAK基因家族全基因组鉴定及其在盐处理下的表达分析)[J].生物工程学报,2022(10):3773-3789
A类：
BvHAK,K+transporter,BvHAKs,BvHAK4,BvHA
B类：
甜菜,基因家族,全基因组鉴定,盐处理,表达分析,亲和性,转运蛋白,high,affinity,白家,吸收和转运,重要功能,生物学功能,基因表达模式,基因结构,染色体定位,保守基序,三维结构,互作网络,启动子,顺式作用元件,qRT,盐胁迫,不同组织,外显子,内含子,平均分子量,kDa,等电点,质膜,液泡,系统进化分析,高等植物,胁迫响应,响应元,激素响应,表达模式分析,NaCl,菜地,地上部,根部,高盐,耐盐性
AB值：
0.273632
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