典型文献
基于转录组的蔗茅CML基因家族鉴定及冷胁迫表达分析
文献摘要：
类钙调蛋白(calmodulin-like protein,CML)是植物细胞中的钙离子结合蛋白,在植物生长发育和逆境胁迫的信号转导中具有重要的功能.为探究冷胁迫下蔗茅(Erianthus fulvus)CML家族基因的表达模式,本研究基于转录组数据在蔗茅中鉴定出39个EfCML家族基因,并进行了生物信息学和冷胁迫下的表达分析.蛋白质理化性质分析表明,蔗茅EfCMLs氨基酸残基数目为59～312,分子量大小为6.24021～34.01778 kD,等电点为3.99～11.14.亚细胞定位预测结果显示,39个EfCMLs分别定位于细胞质、细胞膜和细胞核中.保守结构域分析发现,EfCML家族蛋白含有1～4个典型的EF-hand结构域.基序(motif)分析表明,EfCML家族蛋白含有1～4个典型的Ca2+结合基序.进化树分析表明,EfCMLs蛋白分为11个组群.冷胁迫表达分析表明,低温诱导EfCML家族基因差异表达,其中EfCML1和EfCML2基因表达持续上调,在72 h冷胁迫下达到峰值,分别为对照的27和35倍(P<0.01),呈现最活跃状态.本研究为深入解析蔗茅CML基因的冷胁迫调控机理提供基础资料.
文献关键词：
蔗茅;类钙调蛋白(CML)家族;生物信息学分析;冷胁迫;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
钱禛锋;谷书杰;赵雪婷;饶席兵;曾丹;沈庆庆;张蓉琼;陈疏影;何丽莲;李富生
作者机构：
云南农业大学农学与生物技术学院,昆明650201;云南农业大学甘蔗研究所,昆明650201
文献出处：
引用格式：
[1]钱禛锋;谷书杰;赵雪婷;饶席兵;曾丹;沈庆庆;张蓉琼;陈疏影;何丽莲;李富生-.基于转录组的蔗茅CML基因家族鉴定及冷胁迫表达分析)[J].农业生物技术学报,2022(05):885-895
A类：
fulvus,EfCML,EfCMLs,EfCML1,EfCML2
B类：
蔗茅,基因家族鉴定,冷胁迫,表达分析,类钙调蛋白,calmodulin,like,protein,植物细胞,钙离子,离子结合,结合蛋白,植物生长发育,逆境胁迫,信号转导,Erianthus,家族基因,表达模式,转录组数据,性质分析,氨基酸残基,基数,分子量,kD,等电点,亚细胞定位,定位预测,细胞质,细胞膜,细胞核,保守结构域,EF,hand,基序,motif,Ca2+,进化树分析,组群,基因差异表达,下达,胁迫调控,调控机理,基础资料,生物信息学分析
AB值：
0.309444
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