典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙消痹汤治疗类风湿关节炎的作用机制
文献摘要:
目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙消痹汤治疗类风湿关节炎的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选四妙消痹汤组方中药活性成分及其相关靶点.通过GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传(online mendelian inheritance in man,OMIM)数据库、药物基因组学知识库(pharmacogenomics knowledgebase,PharmGKB)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、DrugBank数据库搜索类风湿关节炎相关疾病靶点,与药物有效成分相关靶点进行映射,取交集即为四妙消痹汤治疗类风湿关节炎的潜在靶点,据此绘制Venn图.将潜在靶点导入STRING在线分析平台获得蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并利用Cytoscape软件中的CytoNCA插件对PPI网络进行拓扑分析,筛选得到核心靶点.利用R语言对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.通过R语言对核心靶点和活性成分进行分子对接.结果:通过TCMSP检索获得四妙消痹汤有效活性成分190个及相关靶点215个.通过GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD及DrugBank数据库获得类风湿关节炎相关疾病靶点2 971个,四妙消痹汤治疗类风湿关节炎的潜在靶点151个.PPI网络拓扑分析筛选得到核心基因JUN、MAPK1、FOS、TP53、ESR1等11种.GO富集分析得到2 452条富集结果,其中生物过程2 178条,分子功能62条,细胞组成212条,KEGG富集分析得到172条信号通路.分子对接结果表明,药物有效成分与核心靶点具有良好亲和力.结论:四妙消痹汤可通过多成分、多靶点、多途径对类风湿关节炎发挥作用.
文献关键词:
类风湿关节炎;四妙消痹汤;网络药理学;分子对接;作用机制
中图分类号:
作者姓名:
许博;马俊福;郑福增;赵晶晶
作者机构:
河南中医药大学,河南 郑州450046;河南省中医院,河南 郑州450000
文献出处:
引用格式:
[1]许博;马俊福;郑福增;赵晶晶-.基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙消痹汤治疗类风湿关节炎的作用机制)[J].中医学报,2022(11):2426-2433
A类:
四妙消痹汤,pharmacogenomics,knowledgebase
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,类风湿关节炎,系统药理学,分析平台,traditional,Chinese,medicine,systems,pharmacology,database,analysis,platform,TCMSP,组方,中药活性成分,GeneCards,线人,孟德尔遗传,online,mendelian,inheritance,man,OMIM,药物基因组学,知识库,PharmGKB,药物靶标,therapeutic,target,TTD,DrugBank,相关疾病,药物有效成分,交集,即为,潜在靶点,Venn,STRING,在线分析,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,Cytoscape,CytoNCA,插件,选得,核心靶点,基因本体,ontology,功能富集分析,京都基因与基因组百科全书,kyoto,encyclopedia,genes,genomes,信号通路富集,通路富集分析,网络拓扑分析,核心基因,JUN,MAPK1,FOS,TP53,ESR1,集结,生物过程,细胞组成,亲和力,多成分,多靶点,多途径
AB值:
0.317781
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