典型文献
基于网络药理学、分子对接及分子动力学模拟探讨甘草查尔酮A治疗阿尔茨海默病的作用机制研究
文献摘要:
目的 从分子层面探讨甘草查尔酮A治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制.方法 通过TCMSP、PharmMapper、SwissTargetPrediction、CTD及DisGeNET等数据库检索出甘草查尔酮A的作用靶点及其与AD相关的靶点的交集.利用Cytoscape 3.7.2软件的ClueGO功能对交集蛋白作KEGG通路富集分析.最终通过分子对接及分子动力学模拟方法从分子层面研究甘草查尔酮A作用于AD相关靶点的结合位点及结合能力.结果 甘草查尔酮A的作用靶点有128个,其中与AD相关的靶点112个,这些靶点涉及信号通路33条,包括MicroRNAs in cancer、Serotonergic synapse及Cell cycle等,从而构建出靶蛋白蛋白相互作用(PPI)、单一成分-靶点-生物学通路网络.分子对接及分子动力学模拟结果显示,甘草查尔酮A与PPI网络图中度值最高的20个靶蛋白均能很好地结合,其中结合性最好的3个靶蛋白分别为视网膜母细胞瘤相关蛋白、环氧合酶2和丁酰胆碱酯酶.结论 从分子层面对甘草查尔酮A治疗AD作用机制进行初步探讨,揭示潜在的生物学机制,为其应用提供理论依据.
文献关键词:
甘草查尔酮A;阿尔茨海默病;网络药理学;分子对接;分子动力学
中图分类号:
作者姓名:
李晴霞;冯鑫;康念欣;姜宇;栾雅格;刘永刚;谭鹏
作者机构:
北京中医药大学中药学院,北京市科委中药生产过程控制与质量评价北京市重点实验室,北京 102488
文献出处:
引用格式:
[1]李晴霞;冯鑫;康念欣;姜宇;栾雅格;刘永刚;谭鹏-.基于网络药理学、分子对接及分子动力学模拟探讨甘草查尔酮A治疗阿尔茨海默病的作用机制研究)[J].药物评价研究,2022(01):71-77
A类:
Serotonergic
B类:
网络药理学,分子对接,分子动力学模拟,甘草,查尔酮,阿尔茨海默病,AD,TCMSP,PharmMapper,SwissTargetPrediction,CTD,DisGeNET,数据库检索,作用靶点,交集,Cytoscape,ClueGO,通路富集分析,结合位点,结合能,MicroRNAs,cancer,synapse,Cell,cycle,靶蛋白,蛋白相互作用,PPI,一成,生物学通路,通路网络,网络图,结合性,视网膜母细胞瘤,环氧合酶,丁酰胆碱酯酶,生物学机制
AB值:
0.304369
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