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高通量测序分析一只临床死亡阿拉伯狒狒的胃肠道菌群
文献摘要：
目的 运用高通量测序分析一只临床死亡的阿拉伯狒狒胃肠道菌群的组成及多样性,结合其临床症状和检测结果进一步分析该动物的死亡原因,为野生动物的饲养管理和物种健康提供基础资料.方法 以2017年12月20日成都动物园一只死亡的幼龄雌性阿拉伯狒狒为研究对象,收集其胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠的内容物及粪便,利用高通量测序技术对细菌16SrRNA基因的V4区进行测序,分析细菌菌群的组成和多样性差异.结果 十二指肠的菌群有效序列数较高,而盲肠和粪便菌群的alpha多样性较高;胃肠道菌群丰度不同,但都主要来自变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门,而大肠具有较多的梭杆菌门;海尔曼螺杆菌和大肠埃希菌分别在胃和小肠富集,嗜肺巴氏杆菌和具核梭杆菌在结肠富集,并且结肠具有较多来自变形菌门的特有细菌;菌群的功能预测提示胃和小肠具有腹泻和胃肠炎风险,结肠具有菌群失调风险.结论 阿拉伯狒狒的胃肠道细菌菌群的高通量测序分析和临床诊断及器官组织病理检测结果表明该动物患有的间质性肺炎与小肠富集的大肠埃希菌关系密切,其直接死亡可能与嗜肺巴氏杆菌有关,这些症状进一步导致其结肠菌群失调而加剧了死亡,提示饲养管理中应加强对动物园阿拉伯狒狒等野生动物肠道大肠埃希菌和嗜肺巴氏杆菌的监测,提高野生动物的饲养管理和物种健康.
文献关键词：
阿拉伯狒狒;胃肠道;菌群;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
蒲阳;曾东;严慧娟;屈羽;李玉飞;李杨;吴礼倩;曾燕
作者机构：
成都动物园,成都市野生动物研究所,四川610081;四川农业大学动物医学院
文献出处：
引用格式：
[1]蒲阳;曾东;严慧娟;屈羽;李玉飞;李杨;吴礼倩;曾燕-.高通量测序分析一只临床死亡阿拉伯狒狒的胃肠道菌群)[J].中国微生态学杂志,2022(10):1139-1145
A类：
阿拉伯狒狒,海尔曼
B类：
高通量测序分析,一只,胃肠道菌群,死亡原因,野生动物,饲养管理,基础资料,动物园,幼龄,雌性,十二指肠,空肠,回肠,盲肠,内容物,高通量测序技术,16SrRNA,V4,细菌菌群,粪便菌群,alpha,菌群丰度,变形菌门,厚壁菌门,拟杆菌门,螺杆菌,大肠埃希菌,小肠,巴氏杆菌,具核梭杆菌,功能预测,和胃,胃肠炎,炎风,菌群失调,肠道细菌,病理检测,患有,间质性肺炎,结肠菌群,高野
AB值：
0.220086
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