典型文献
基于网络药理学和生物信息学研究黄芪与黄蜀葵花配伍治疗糖尿病肾病的作用机制
文献摘要：
目的 采用网络药理学和生物信息学方法预测黄芪与黄蜀葵花配伍治疗糖尿病肾病(Diabetic kidney disease,DKD)的关键靶点,并探讨其可能的分子机制.方法 检索中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中黄芪、黄蜀葵花,筛选黄芪、黄蜀葵花活性成分和作用靶点;借助GEO2R在线工具挖掘GEO数据库中DKD差异表达基因;从Gene Cards数据库获取与DKD有关的靶点,并与差异表达基因、药物靶点进行映射,得到共同靶点;借助Cytoscape3.7软件构建"黄芪—黄蜀葵花—活性成分—靶点—DKD"网络;运用String数据库构建共同靶点PPI网络,筛选关键靶点,并用David数据库对关键靶点进行基因本体(GO)和京都基因百科全书(KEGG)通路富集分析;将关键靶点与活性成分进行分子对接验证.结果 黄芪、黄蜀葵花一共有22个化合物,槲皮素同时存在于二味药中,其中槲皮素和山奈酚在调控DKD中起主要作用;PPI网络的关键靶点为EGF,CASP3,CCL2,ICAM1,VCAM1,CXCL10,STAT1和SPP1;GO功能富集主要涉及细胞对环状化合物的反应、对缺氧反应、对脂多糖反应、细胞粘附、血管生成负调控和对细胞外渗的正调控等,KEGG信号通路主要涉及肿瘤坏死因子信号通路、乙型肝炎通路、甲型流感通路、MAPK信号通路和Toll样信号通路等;分子对接结果显示槲皮素、山奈酚与1CAM1和EGF靶点结合较原配体紧密.结论 黄芪在两药配伍中起主导作用,山奈酚与关键靶点的结合较槲皮素紧密,推测山奈酚、槲皮素、1CAM1和EGF可能作为抗DKD的候选药物及作用靶标.
文献关键词：
黄芪;黄蜀葵花;糖尿病肾病;网络药理学;生物信息学;作用机制
中图分类号：
作者姓名：
吴波;喻志阳;王玥坤;张伶俐;陈醒;魏玮;高茗;蓝晓红
作者机构：
中国人民解放军东部战区总医院药剂科,江苏 南京 210002;中国人民解放军东部战区总医院第四派驻门诊部药剂科,江苏 南京 210000
文献出处：
引用格式：
[1]吴波;喻志阳;王玥坤;张伶俐;陈醒;魏玮;高茗;蓝晓红-.基于网络药理学和生物信息学研究黄芪与黄蜀葵花配伍治疗糖尿病肾病的作用机制)[J].中国现代医药杂志,2022(03):7-13
A类：
1CAM1
B类：
网络药理学,生物信息学研究,黄芪,黄蜀葵花,配伍,治疗糖尿病肾病,生物信息学方法,Diabetic,kidney,disease,DKD,关键靶点,系统药理学,分析平台,TCMSP,中黄,活性成分,作用靶点,GEO2R,差异表达基因,Gene,Cards,药物靶点,Cytoscape3,软件构建,String,数据库构建,PPI,选关,David,基因本体,京都,百科全书,通路富集分析,分子对接,一共,个化,槲皮素,二味,山奈酚,EGF,CASP3,CCL2,ICAM1,VCAM1,CXCL10,STAT1,SPP1,功能富集,脂多糖,细胞粘附,血管生成,负调控,外渗,正调控,肿瘤坏死因子信号通路,乙型肝炎,甲型流感,感通,MAPK,Toll,原配,候选药物,靶标
AB值：
0.296971
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