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基于计算机分子模拟技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂
文献摘要：
目的:采用分子对接技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂。方法:研究时间为2021年1月至9月。基于过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARγ）的PDB晶型结构（PDB Code：6md4），构建虚拟靶标模型，以天然产物数据库中的1 680个化合物为配体筛选对象，以6md4原配体分子为对照。首先采用SYBYL软件对天然小分子化合物进行虚拟筛选，随后对排名前20位的化合物进行高精度分子对接，最后再使用PyMol软件分析结合稳定的化合物。结果:根据评分结果并结合冲突、极性和相似度，最终筛选出橙皮苷等20个小分子PPARγ激动剂，其中橙皮苷能够与PPARγSer289、His323、Tyr327等多个氨基酸形成氢键，结合良好。结论:从天然产物中筛选出潜在的PPARγ激动剂，为发现新型抗糖尿病的先导化合物或膳食补充剂提供基础。
文献关键词：
2型糖尿病;PPARγ;计算机虚拟筛选;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
刘治国;崔文强;魏叶;朱心瑶;杨雪
作者机构：
南京医科大学附属宿迁第一人民医院 宿迁市第一人民医院，宿迁 223800;东北农业大学，哈尔滨 150030;徐州医科大学，徐州 221004
文献出处：
引用格式：
[1]刘治国;崔文强;魏叶;朱心瑶;杨雪-.基于计算机分子模拟技术从天然产物中筛选PPARγ激动剂)[J].国际医药卫生导报,2022(09):1204-1208
A类：
6md4,Ser289,His323,Tyr327
B类：
分子模拟技术,天然产物,PPAR,激动剂,分子对接技术,过氧化物酶体增殖物激活受体,PDB,晶型结构,Code,靶标,个化,选对,原配,SYBYL,小分子化合物,PyMol,合冲,橙皮苷,氢键,抗糖尿病,先导化合物,膳食补充剂,计算机虚拟筛选
AB值：
0.267614
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