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典型文献
基于网络药理学与分子对接探究银杏叶提取物治疗动脉粥样硬化的作用机制
文献摘要:
目的 运用网络药理学及分子对接技术探究银杏叶提取物治疗动脉粥样硬化的作用机制.方法 在TCMSP平台筛选出银杏叶的活性成分,在Swiss Target Prediction数据平台和GeneCards数据库收集活性成分对应的靶点,在Gene-Cards和DisGeNET数据库检索"动脉粥样硬化"的相关靶点,通过Venny平台获得两者间的共同靶点.将共同靶点导入STRING数据库,利用Cytoscape 3.8.0构建蛋白互作网络和核心靶点网络,并获取拓扑参数.利用DAVID进行GO和KEGG通路富集分析,并对结果运用微生信和OmicShare平台进行图像可视化处理.采用Cytoscape 3.8.0软件进行"活性成分-靶点-疾病"网络模型构建与分析,最后使用AutoDock、Pymol软件进行重要成分和核心靶点的分子对接并预测其结合能力.结果 从银杏叶中筛选出27个活性成分,动脉粥样硬化和活性成分的共同靶点有163个,其中核心靶点有7个,主要有关通路有PPAR信号通路、TNF信号通路以及Proteoglycans in cancer信号通路等.分子对接结果显示,所有核心靶点与活性成分的分子对接结合自由能均较小,即具有较好的亲和力,其中槲皮素-HRAS的亲和力最大,山柰酚-VEGFA次之.结论 银杏叶提取物可能从抗氧化应激、抑制炎症激活、调节血管内皮细胞的凋亡和功能障碍等多方面发挥对动脉粥样硬化的治疗作用,为银杏叶提取物的开发和应用提供新的思路和理论依据.
文献关键词:
动脉粥样硬化;网络药理学;银杏叶提取物;靶点;信号通路;分子对接
作者姓名:
万一鸣;李云鹏;桑海强
作者机构:
郑州大学第一附属医院 心血管内科,河南 郑州 450052
文献出处:
引用格式:
[1]万一鸣;李云鹏;桑海强-.基于网络药理学与分子对接探究银杏叶提取物治疗动脉粥样硬化的作用机制)[J].河南医学研究,2022(01):1-9
A类:
B类:
网络药理学与分子对接,银杏叶提取物,动脉粥样硬化,分子对接技术,技术探究,TCMSP,活性成分,Swiss,Target,Prediction,GeneCards,DisGeNET,数据库检索,Venny,STRING,Cytoscape,蛋白互作网络,核心靶点,靶点网络,拓扑参数,DAVID,通路富集分析,结果运用,生信,OmicShare,可视化处理,AutoDock,Pymol,结合能,PPAR,Proteoglycans,cancer,结合自由能,亲和力,槲皮素,HRAS,山柰酚,VEGFA,抗氧化应激,抑制炎症,血管内皮细胞,治疗作用
AB值:
0.273484
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