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典型文献
车前草基于GEO芯片数据前列腺癌特征基因的生物信息学分析
文献摘要:
目的:通过生物信息学方法探索车前草在前列腺癌治疗的相关性.方法:采用GEO数据获取前列腺癌芯片数据,利用GEO2R分析前列腺癌组织与正常组织差异表达基因;通过TCMSP数据库获取车前草靶点与差异表达基因取交集;利用GO数据库和KEGG数据库对关键基因进行富集和功能注释;关键基因构建蛋白质互相作用网络获取核心基因;对核心基因进行免疫组织分析.结果:共筛选出1553个差异表达基因,其中985个为上调基因,568个为下调基因;差异表达基因与车前草靶点共有基因为14个;蛋白质互相作用网络得到核心基因VEGFA、EGFR、PTGS2、BCL2、PGR、ESR1.结论:车前草可通过靶点PTGS2基因表达,PTGS2基因可作为前列腺癌预后标志物以及潜在治疗分子靶点.
文献关键词:
车前草;基因;生物信息学;免疫
作者姓名:
赵军军;鲁兰;卢欢;程强;杨晨;余能
作者机构:
成都大学四川抗菌素工业研究所 成都 610052;江西中医药大学 南昌 330004;成都晶富医药科技有限公司 成都 610041
引用格式:
[1]赵军军;鲁兰;卢欢;程强;杨晨;余能-.车前草基于GEO芯片数据前列腺癌特征基因的生物信息学分析)[J].江西中医药大学学报,2022(06):70-74
A类:
B类:
车前草,前列腺癌,特征基因,生物信息学分析,生物信息学方法,方法探索,数据获取,GEO2R,分析前,癌组织,正常组织,组织差异表达,差异表达基因,TCMSP,交集,关键基因,功能注释,蛋白质互相作用网络,核心基因,免疫组织,组织分析,VEGFA,EGFR,PTGS2,BCL2,PGR,ESR1,预后标志物,潜在治疗,分子靶点
AB值:
0.303913
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