典型文献
基于网络药理学和生物信息学探讨西黄丸治疗乳腺癌作用机制
文献摘要：
目的 运用网络药理学相关方法对西黄丸治疗乳腺癌的机制进行系统预测及分析.方法 通过TCMSP、中药与化学成分数据库及本草组鉴数据库检索西黄丸的相关成分及靶点,根据ADME平台筛选中药有效活性成分.检索Gene Cards、OMIM数据库获取乳腺癌的疾病靶点,并基于GEO数据库下载并分析芯片GSE33447,筛选出健康人与乳腺癌患者的差异基因.采用Cytoscape 3.7.1软件构建药物-化合物-治疗靶点网络,基于String平台绘制蛋白互作网络(PPI),采用R3.6.1软件对治疗靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析以及基因组百科全书(Kyoto Encyclope-dia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析.结果 共筛选出相关化合物106个,有效成分47个,药物疾病交集靶点76个.西黄丸治疗乳腺癌的重要成分为Quercetin、Petunidin、Morin、Beta-Sitosterol和Ellagic acid等.PPI网络显示度值排名前10位的靶基因为CASP3、EGFR、IL6、MYC、VEGFA、ESR1、CCND1、ERBB2、FOS、AR.GO富集分析得到乳腺癌相关的1277个生物学过程(BP)、85个分子功能(MF)及37个细胞组分(CC).KEGG富集分析预测出西黄丸治疗乳腺癌可能是通过AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡相关通路、雌激素信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂抵抗通路、低氧诱导因子-1信号通路、TNF通路及p53信号通路等关键信号通路达到治疗效果.结论 西黄丸通过多靶点、多通路的形式治疗乳腺癌,本文为进一步研究该药治疗乳腺癌的作用机制提供了理论参考.
文献关键词：
西黄丸;乳腺癌;生物信息学;网络药理学;差异基因
中图分类号：
作者姓名：
来保勇;于博文;刘宇飞;余红;裴晓华
作者机构：
北京中医药大学厦门医院,福建厦门361001;厦门市中医院,福建厦门361001;北京中医药大学第三附属医院,北京100029;清华大学玉泉医院,北京100040
文献出处：
引用格式：
[1]来保勇;于博文;刘宇飞;余红;裴晓华-.基于网络药理学和生物信息学探讨西黄丸治疗乳腺癌作用机制)[J].辽宁中医杂志,2022(10):153-159,后插1-后插2
A类：
GSE33447,Morin,Sitosterol
B类：
网络药理学,西黄丸,相关方法,TCMSP,成分数据,本草,数据库检索,ADME,选中,活性成分,Cards,OMIM,GEO,下载,健康人,乳腺癌患者,差异基因,Cytoscape,软件构建,治疗靶点,靶点网络,String,蛋白互作网络,PPI,R3,基因本体,gene,ontology,富集分析,百科全书,Kyoto,Encyclope,dia,Genes,Genomes,通路分析,有效成分,交集靶点,Quercetin,Petunidin,Beta,Ellagic,acid,显示度,靶基因,CASP3,EGFR,IL6,MYC,VEGFA,ESR1,CCND1,ERBB2,FOS,生物学过程,MF,分析预测,预测出,RAGE,相关通路,雌激素信号通路,酪氨酸激酶抑制剂,低氧诱导因子,p53,多靶点,多通路,该药
AB值：
0.379244
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