典型文献
生物信息学方法分析筛选扩张型心肌病发生发展的关键基因和通路
文献摘要：
目的 利用生物信息学方法探究扩张型心肌病潜在的生物标记物和相关富集通路.方法 搜索GEO数据库中与扩张型心肌病相关的数据集,提取人心肌细胞的两张芯片GSE42955和GSE1869,然后利用R语言进行差异基因分析、蛋白互作网络分析、鉴定差异表达的核心基因和核心模块并进行基因本体数据库(GO)富集、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析.搜索ArrayExpress数据库与扩张型心肌病相关的数据集,提取出人心肌细胞芯片E-TABM-480,验证核心基因和模块在其中的表达情况.结果 共验证出10个差异表达基因,即DZIP3、FBXO32、BTBD6、FBXL5、ASB8、COMMD1、LTN1、FBXO21、RCHY1、ARIH2,核心差异基因为DZIP3,经GO和KEGG,上述差异基因的生物学过程主要集中在泛素和蛋白酶体相关的生物学过程和通路中.结论 生物信息学分析显示,泛素-蛋白酶系统在扩张型心肌病发病中具有重要作用,其机制尚待进一步研究.
文献关键词：
扩张型心肌病;差异表达基因;富集分析;生物标志物;泛素-蛋白酶系统
中图分类号：
作者姓名：
何明俊;白玲;卢群;褚超;任洁;牟建军
作者机构：
西安交通大学第一附属医院心内科,陕西西安 710061
文献出处：
引用格式：
[1]何明俊;白玲;卢群;褚超;任洁;牟建军-.生物信息学方法分析筛选扩张型心肌病发生发展的关键基因和通路)[J].西安交通大学学报（医学版）,2022(03):395-406
A类：
GSE42955,GSE1869,TABM,DZIP3,BTBD6,ASB8,COMMD1,LTN1,FBXO21,RCHY1,ARIH2
B类：
生物信息学方法,扩张型心肌病,关键基因,利用生物,方法探究,生物标记物,富集通路,GEO,心肌细胞,两张,差异基因分析,蛋白互作网络分析,核心基因,核心模块,基因本体,京都基因与基因组百科全书,通路分析,ArrayExpress,证出,差异表达基因,FBXO32,FBXL5,生物学过程,泛素,蛋白酶体,生物信息学分析,酶系统,尚待,富集分析,生物标志物
AB值：
0.220696
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