目的 挖掘异常表达的胃癌干性基因LGR5、CD44、ASPM、ABCG2及PSCA在胃癌诊断、治疗及预后中的潜在生物学价值.方法 UALCAN和Oncomine数据库分析LGR5、CD44、ASPM、ABCG2及PSCA的基因表达水平;借助cBioPortal分析干性基因变异及其与患者生存之间的影响;Kaplan-Meier plotter分析干性基因表达与患者生存之间的关系;LinkedOmics分析干性基因正负相关的网络基因;MetaScape数据库分析干性基因及网络基因功能注释及基因通路;IMER数据库研究干性基因与免疫细胞浸润的相关性,并分析免疫细胞对胃癌患者生存的影响.结果 胃癌组织中LGR5、CD44及ASPM mRNA水平及DNA拷贝数高于相应的正常组织(P<0.05),ABCG2和PSCA mRNA水平低于正常组织(P<0.05),而PSCA的DNA拷贝数高于正常组织(P<0.05),ABCG2的DNA拷贝数无统计学意义;LGR5、CD44、ABCG2高表达组的总生存期明显短于低表达组(HR>1,P<0.05);ASPM高表达组长于对照组(HR<1,P<0.05);PSCA表达与胃癌患者生存期无统计学意义(HR>1,P>0.05);LGR5、ASPM及ABCG2变异类型最多的是突变变异,CD44及PSCA最多的是扩增性变异,ASPM变异可提高胃癌患者5年生存期,ABCG2变异不利于胃癌患者5年生存期,且具有统计学意义(P<0.05);功能网络分析表明5个干性基因及相关网络基因参与了细胞有丝分裂、脂肪消化吸收、MicroRNAs调节及蛋白运输等过程;干性基因的表达与CD4+T、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞浸润水平有相关性.结论 5种胃癌干性基因的表达、突变、调节与胃癌发生发展、患者的预后及免疫细胞浸润间的关系密切相关,为进一步研究这些干性基因在胃癌中的作用奠定了基础.

胃癌;胃癌干性基因;数据库和价值

余水红;马军;钱燕;龚莉

安庆医药高等专科学校科研中心;安庆市立医院普外科;安庆师范大学生命科学学院,安徽 安庆 246502

牡丹江医学院学报

[1]余水红;马军;钱燕;龚莉-.基于数据库挖掘5种胃癌干性基因在胃癌中潜在价值研究)[J].牡丹江医学院学报,2022(02):17-24

胃癌干性基因,IMER,数据库和价值

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